More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3925 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  100 
 
 		 445 aa  901    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 434 aa  322  8e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 434 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 432 aa  266  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 432 aa  232  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 434 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 417 aa  213  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 434 aa  212  9e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  31.88 
 
 		 414 aa  202  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 441 aa  200  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 425 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 446 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  31.01 
 
 		 430 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  32.88 
 
 		 430 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 437 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  31.63 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  31.87 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  30.28 
 
 		 426 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  30.93 
 
 		 426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 439 aa  169  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  28.14 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  28.32 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  31.38 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  28.23 
 
 		 443 aa  151  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  30.87 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  26.74 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  28.28 
 
 		 443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 443 aa  146  9e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  26.28 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  26.79 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  28.27 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  27.11 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  27.68 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 412 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  25.75 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 405 aa  133  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  25.52 
 
 		 428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  24.38 
 
 		 423 aa  130  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  27.59 
 
 		 420 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 407 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  24.63 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 427 aa  129  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  28.43 
 
 		 420 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  27.23 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  25.7 
 
 		 425 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  25.7 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  28.73 
 
 		 430 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  28.73 
 
 		 430 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  25.75 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  25.47 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  30.46 
 
 		 412 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  28.11 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  30.46 
 
 		 412 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  30.46 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  30.46 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  30.46 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  26.1 
 
 		 432 aa  119  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  29.1 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  25.64 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  29.9 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  25.37 
 
 		 446 aa  113  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  24.69 
 
 		 418 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  25.37 
 
 		 446 aa  113  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1823  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.262601  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.69 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 430 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  27.48 
 
 		 443 aa  110  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 460 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  23.41 
 
 		 432 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  23.87 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>