18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3553 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3553  hypothetical protein  100 
 
 		 658 aa  1358    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2702  Beta-agarase  29.77 
 
 		 475 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0145383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3029  agarase  31.07 
 
 		 451 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.933436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2419  agarase  31.05 
 
 		 450 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.720611  normal  0.0278267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4624  agarase  30.91 
 
 		 456 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19460  Agarase  30.22 
 
 		 801 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1147  Beta-agarase  29.98 
 
 		 755 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.821905  normal  0.315056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1162  Beta-agarase  28.57 
 
 		 744 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50830  hypothetical protein  27.73 
 
 		 757 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4289  Beta-agarase  28.93 
 
 		 744 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1126  Beta-agarase  27.96 
 
 		 782 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1226  hydrolase, putative  29.87 
 
 		 826 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2644  GTPase EngC  25.45 
 
 		 793 aa  98.6  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  0.285653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2642  agarase  26.02 
 
 		 782 aa  95.9  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1176  agarase  24.68 
 
 		 777 aa  94  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000515097  unclonable  0.0000000139638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2081  hypothetical protein  23.72 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.40014  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2640  agarase  22.07 
 
 		 813 aa  77  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.503821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1971  agarase  23.08 
 
 		 793 aa  74.7  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0111275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>