220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2410 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0753  phosphoglyceromutase  61.31 
 
 		 546 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2410  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 550 aa  1139    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6862  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  56.07 
 
 		 552 aa  605  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109748 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0072  phosphoglyceromutase  55.74 
 
 		 550 aa  600  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0233  phosphoglyceromutase  56.34 
 
 		 546 aa  598  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33106  predicted protein  44.57 
 
 		 547 aa  441  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0393465  normal  0.249426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  38.91 
 
 		 525 aa  342  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  39.29 
 
 		 517 aa  335  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  39.81 
 
 		 512 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  39.41 
 
 		 512 aa  330  4e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  38.01 
 
 		 518 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  39.48 
 
 		 514 aa  324  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  37.82 
 
 		 512 aa  323  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  38.95 
 
 		 511 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  38.69 
 
 		 512 aa  323  7e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  37.87 
 
 		 512 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  38.09 
 
 		 516 aa  320  5e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  39.6 
 
 		 513 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  39.37 
 
 		 510 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  37.66 
 
 		 513 aa  315  9e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  37.73 
 
 		 516 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  37.73 
 
 		 516 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  36.85 
 
 		 511 aa  312  7.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  39.07 
 
 		 508 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  37.04 
 
 		 516 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  37.02 
 
 		 516 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  37.55 
 
 		 516 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  37.38 
 
 		 512 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  37.36 
 
 		 515 aa  307  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  37.27 
 
 		 512 aa  307  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  40.15 
 
 		 505 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  37.78 
 
 		 509 aa  306  6e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  37.59 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  37.59 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  37.59 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  37.59 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  38.59 
 
 		 509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  37.78 
 
 		 509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  36.92 
 
 		 518 aa  304  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  37.59 
 
 		 509 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  37.9 
 
 		 512 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  37.59 
 
 		 509 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  37.52 
 
 		 511 aa  302  9e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  37.41 
 
 		 509 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  36.23 
 
 		 511 aa  300  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  37.41 
 
 		 509 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  38.93 
 
 		 509 aa  300  5e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  37.01 
 
 		 510 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  37.52 
 
 		 511 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  36.18 
 
 		 511 aa  297  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  37.5 
 
 		 521 aa  297  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  36.6 
 
 		 524 aa  296  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  37.29 
 
 		 514 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  35.39 
 
 		 517 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  36.87 
 
 		 512 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  37.2 
 
 		 509 aa  293  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  37.5 
 
 		 511 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  38.36 
 
 		 510 aa  293  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  37.2 
 
 		 514 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  37.2 
 
 		 514 aa  293  8e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  36.36 
 
 		 529 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  37.11 
 
 		 510 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  37.29 
 
 		 514 aa  292  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  36.26 
 
 		 510 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  35.94 
 
 		 511 aa  292  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  36.87 
 
 		 512 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  37.02 
 
 		 514 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  36.8 
 
 		 514 aa  290  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  36.13 
 
 		 515 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  37.21 
 
 		 514 aa  289  9e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  37.29 
 
 		 514 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  37.32 
 
 		 511 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  36.83 
 
 		 514 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  37.32 
 
 		 511 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  38.12 
 
 		 510 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  37.23 
 
 		 511 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  36.65 
 
 		 514 aa  286  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  37.02 
 
 		 514 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  37.02 
 
 		 514 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  37.02 
 
 		 514 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  37.02 
 
 		 514 aa  286  5.999999999999999e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  37.02 
 
 		 514 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  37.02 
 
 		 514 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  37.02 
 
 		 514 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  36.66 
 
 		 514 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1614  phosphoglyceromutase  36.55 
 
 		 491 aa  286  8e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.108207  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  36.66 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0684  phosphoglyceromutase  38.59 
 
 		 509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113328 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  36.19 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0526  phosphoglyceromutase  38.59 
 
 		 509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.594564  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  36.46 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  37.29 
 
 		 523 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  36.66 
 
 		 514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  36.53 
 
 		 514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  35.44 
 
 		 509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  37.29 
 
 		 514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  36.53 
 
 		 525 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  36.11 
 
 		 516 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  37.04 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  36.66 
 
 		 514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>