220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6862 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0753  phosphoglyceromutase  58.68 
 
 
546 aa  649    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6862  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  100 
 
 
552 aa  1132    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.109748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2410  phosphoglyceromutase  56.07 
 
 
550 aa  605  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716907  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0233  phosphoglyceromutase  53.49 
 
 
546 aa  600  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0072  phosphoglyceromutase  53.3 
 
 
550 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33106  predicted protein  50.37 
 
 
547 aa  506  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0393465  normal  0.249426 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  38.55 
 
 
516 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  39.59 
 
 
516 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  38.18 
 
 
516 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  38.62 
 
 
516 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  38.92 
 
 
510 aa  350  4e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  38.22 
 
 
516 aa  349  8e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  39.07 
 
 
511 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  37.13 
 
 
514 aa  346  6e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  37.92 
 
 
512 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  38.29 
 
 
508 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  38.66 
 
 
518 aa  341  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  38.29 
 
 
513 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  37.43 
 
 
516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  38.06 
 
 
509 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  38.98 
 
 
521 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  38.26 
 
 
513 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  36.57 
 
 
512 aa  335  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  36.5 
 
 
525 aa  334  3e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  37.11 
 
 
509 aa  334  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  37.11 
 
 
509 aa  333  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  37.11 
 
 
509 aa  333  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  37.11 
 
 
509 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  36.53 
 
 
512 aa  333  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  37.17 
 
 
509 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  37.17 
 
 
509 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  37.15 
 
 
509 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  37.57 
 
 
512 aa  330  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  36.97 
 
 
509 aa  330  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  38.14 
 
 
524 aa  329  6e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  37.34 
 
 
505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  37.34 
 
 
505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  38.06 
 
 
511 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  37.36 
 
 
512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  37.29 
 
 
512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  35.17 
 
 
512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  34.43 
 
 
512 aa  327  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  37.11 
 
 
509 aa  327  5e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  37.48 
 
 
510 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  35.85 
 
 
512 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  38.56 
 
 
510 aa  325  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  37.94 
 
 
511 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  36.41 
 
 
515 aa  324  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  37.74 
 
 
515 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  38.43 
 
 
509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  37.57 
 
 
511 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  36.65 
 
 
529 aa  321  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  36.5 
 
 
510 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  36.36 
 
 
509 aa  320  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  37.31 
 
 
525 aa  319  6e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  34.81 
 
 
517 aa  319  7e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  37.57 
 
 
509 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  37.92 
 
 
515 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  34.31 
 
 
512 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  37.92 
 
 
511 aa  318  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  37.34 
 
 
511 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  37.55 
 
 
505 aa  317  3e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  37.15 
 
 
513 aa  317  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  34.69 
 
 
513 aa  316  7e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  35.2 
 
 
511 aa  316  7e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  37.92 
 
 
511 aa  316  9e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  36.31 
 
 
515 aa  314  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  36.77 
 
 
505 aa  313  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  36.99 
 
 
519 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  35.75 
 
 
514 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  35.57 
 
 
514 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  37.34 
 
 
514 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  35.39 
 
 
516 aa  310  5e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  34.38 
 
 
511 aa  309  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  36.65 
 
 
514 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  34.32 
 
 
532 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  34.32 
 
 
532 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  37.17 
 
 
511 aa  307  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  37.41 
 
 
514 aa  306  6e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  37.41 
 
 
514 aa  306  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  34.39 
 
 
514 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  35.06 
 
 
518 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  35.36 
 
 
514 aa  305  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  37.22 
 
 
514 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  37.22 
 
 
514 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  37.22 
 
 
514 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  34.19 
 
 
516 aa  304  3.0000000000000004e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  37.22 
 
 
514 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16241  phosphoglyceromutase  33.52 
 
 
540 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  37.22 
 
 
514 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  37.22 
 
 
514 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  37.22 
 
 
514 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  34.64 
 
 
517 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  35.4 
 
 
514 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  35.4 
 
 
514 aa  303  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  35.4 
 
 
514 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  35.4 
 
 
514 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  35.4 
 
 
514 aa  302  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  36.47 
 
 
511 aa  301  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  36.7 
 
 
517 aa  300  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>