20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1308 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1308  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  857    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2249  hypothetical protein  42.59 
 
 		 362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000978624  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2422  hypothetical protein  43.48 
 
 		 161 aa  99.8  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0886  hypothetical protein  43.36 
 
 		 631 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.57162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3677  FG-GAP repeat-containing protein  38.6 
 
 		 639 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.431632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2010  calx-beta domain-containg protein  39.08 
 
 		 601 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  40.78 
 
 		 4013 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  36.47 
 
 		 1222 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.78 
 
 		 1180 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  33.63 
 
 		 1418 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  38.46 
 
 		 1037 aa  53.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  38.16 
 
 		 2305 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  39.13 
 
 		 2310 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.96 
 
 		 1269 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.96 
 
 		 1269 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  29.94 
 
 		 932 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.99 
 
 		 768 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  35.65 
 
 		 8871 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.36 
 
 		 1800 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  28.66 
 
 		 750 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>