17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2010 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2010  calx-beta domain-containg protein  100 
 
 		 601 aa  1227    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1308  hypothetical protein  39.08 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  41.24 
 
 		 4013 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0886  hypothetical protein  35.48 
 
 		 631 aa  60.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.57162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3677  FG-GAP repeat-containing protein  36.04 
 
 		 639 aa  55.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.431632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  32.46 
 
 		 4848 aa  51.6  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.57 
 
 		 1661 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  32.58 
 
 		 4214 aa  48.5  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  34.78 
 
 		 1598 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  34.86 
 
 		 2310 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.57 
 
 		 1340 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  34.65 
 
 		 1029 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12503  putative surface layer protein  27.52 
 
 		 465 aa  46.2  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  24.32 
 
 		 1222 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.65 
 
 		 1029 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.98 
 
 		 1800 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  31.54 
 
 		 2305 aa  44.3  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>