More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0478 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  47.14 
 
 		 771 aa  695    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  100 
 
 		 773 aa  1586    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  42.27 
 
 		 764 aa  550  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  41.2 
 
 		 768 aa  545  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  53.2 
 
 		 318 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  54.85 
 
 		 308 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  53.4 
 
 		 354 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  53.06 
 
 		 299 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  52.03 
 
 		 302 aa  320  6e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3359  cysteine synthases  54.39 
 
 		 305 aa  320  7e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  53.04 
 
 		 307 aa  318  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1024  cysteine synthase  53.56 
 
 		 305 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  53.92 
 
 		 308 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  48.14 
 
 		 305 aa  287  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3158  cysteine synthase B  53.92 
 
 		 308 aa  281  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1314  cysteine synthase  50.85 
 
 		 322 aa  277  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  47.23 
 
 		 308 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0231  cysteine synthase B  50.17 
 
 		 321 aa  276  2.0000000000000002e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000104682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0720  cysteine synthase  50.51 
 
 		 321 aa  275  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  52.15 
 
 		 306 aa  273  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  46.58 
 
 		 311 aa  272  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  45.92 
 
 		 296 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  49.66 
 
 		 317 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  44.95 
 
 		 294 aa  270  5e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  44.95 
 
 		 294 aa  270  5e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1653  cysteinyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 471 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  46.31 
 
 		 299 aa  269  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  44.93 
 
 		 297 aa  268  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  49.03 
 
 		 308 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  44.85 
 
 		 299 aa  266  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0315  cysteine synthase  48.31 
 
 		 318 aa  266  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.70232  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  46.49 
 
 		 303 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  46.62 
 
 		 308 aa  264  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  43.96 
 
 		 312 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  43.96 
 
 		 299 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  46.18 
 
 		 292 aa  264  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  43.96 
 
 		 312 aa  264  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  46.18 
 
 		 292 aa  264  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  47.1 
 
 		 309 aa  263  8e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  45.82 
 
 		 303 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  44.9 
 
 		 299 aa  262  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  45.6 
 
 		 304 aa  263  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  45.82 
 
 		 303 aa  263  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  47.9 
 
 		 309 aa  263  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  45.82 
 
 		 303 aa  263  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  45.82 
 
 		 303 aa  263  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  46.18 
 
 		 292 aa  263  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  44.97 
 
 		 300 aa  262  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  45.82 
 
 		 300 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  45.16 
 
 		 308 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  45.82 
 
 		 300 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  44.3 
 
 		 312 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  44.41 
 
 		 295 aa  262  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  48.21 
 
 		 309 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  45.82 
 
 		 303 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  45.42 
 
 		 311 aa  261  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  47.88 
 
 		 309 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  44.75 
 
 		 295 aa  261  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  45.42 
 
 		 312 aa  261  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  48.21 
 
 		 309 aa  261  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  42.95 
 
 		 299 aa  261  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  45.9 
 
 		 310 aa  260  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  45.9 
 
 		 310 aa  260  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  45.48 
 
 		 300 aa  260  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  48.21 
 
 		 309 aa  260  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  43.73 
 
 		 297 aa  260  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  42.95 
 
 		 299 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  43.81 
 
 		 306 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  45.42 
 
 		 312 aa  259  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  45.15 
 
 		 300 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  44.18 
 
 		 294 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  45.92 
 
 		 303 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  45.15 
 
 		 300 aa  259  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  46.94 
 
 		 296 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  44.97 
 
 		 300 aa  258  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  46.01 
 
 		 311 aa  258  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  48.06 
 
 		 308 aa  258  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  46.05 
 
 		 310 aa  258  4e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  44.3 
 
 		 300 aa  257  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  44.33 
 
 		 311 aa  257  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  43.71 
 
 		 301 aa  257  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  45.99 
 
 		 297 aa  257  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  44.19 
 
 		 309 aa  257  7e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  45.15 
 
 		 300 aa  256  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  44.56 
 
 		 303 aa  256  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  44.56 
 
 		 303 aa  256  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  44.56 
 
 		 303 aa  256  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  44.56 
 
 		 303 aa  256  9e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0839  cysteine synthase B  49.16 
 
 		 316 aa  256  9e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0067092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  44.56 
 
 		 303 aa  256  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  44.22 
 
 		 303 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  45.33 
 
 		 293 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  45.05 
 
 		 303 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  44.82 
 
 		 300 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  44.56 
 
 		 303 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  44.93 
 
 		 303 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  44.71 
 
 		 303 aa  256  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  44.82 
 
 		 300 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  44.71 
 
 		 303 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  50.16 
 
 		 309 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>