70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3856 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  60.75 
 
 		 328 aa  361  6e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  54.95 
 
 		 308 aa  339  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  56.36 
 
 		 277 aa  322  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001475  permease  50 
 
 		 300 aa  318  7e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.310077  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05416  hypothetical protein  51.03 
 
 		 300 aa  318  7.999999999999999e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2058  hypothetical protein  48.97 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0938431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1897  hypothetical protein  47.93 
 
 		 295 aa  286  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  46.6 
 
 		 295 aa  281  9e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2070  hypothetical protein  50.91 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2190  hypothetical protein  48.64 
 
 		 298 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  46.37 
 
 		 293 aa  272  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  46.37 
 
 		 293 aa  272  6e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  46.37 
 
 		 293 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  46.39 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.860733 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.02 
 
 		 293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  46.39 
 
 		 307 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  46.39 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  46.02 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  46.39 
 
 		 293 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  46.05 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2109  hypothetical protein  41.84 
 
 		 316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0115021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  41.36 
 
 		 328 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3483  hypothetical protein  42 
 
 		 314 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  0.164721 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4555  hypothetical protein  42 
 
 		 314 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  45.33 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3885  hypothetical protein  41.2 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5820  hypothetical protein  41.28 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4484  hypothetical protein  41.2 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  46.3 
 
 		 274 aa  254  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  46.3 
 
 		 274 aa  254  8e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  46.3 
 
 		 274 aa  254  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1370  hypothetical protein  40.2 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  0.119538 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1959  hypothetical protein  45.24 
 
 		 297 aa  249  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  41.36 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5633  hypothetical protein  41.08 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1390  hypothetical protein  39.25 
 
 		 303 aa  228  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  36.48 
 
 		 306 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3357  hypothetical protein  40.77 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000721544  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1026  hypothetical protein  40.77 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.715879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3485  hypothetical protein  41.11 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000551734  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1367  hypothetical protein  37.71 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1735  inner membrane protein YddG  46.45 
 
 		 162 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3055  hypothetical protein  37.76 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  26.9 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  27.74 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  25.23 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  27.65 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  25.53 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  27.27 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  26.11 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  24.92 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  29.01 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  27.14 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  24.71 
 
 		 288 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  23.6 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.89 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  24.52 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.54 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  24.72 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  23.84 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  28.63 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  24.19 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0463  hypothetical protein  23.04 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  25.94 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.42 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0470  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.44 
 
 		 284 aa  42.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>