32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1530 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1530  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2317  hypothetical protein  53.96 
 
 		 283 aa  315  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1798  hypothetical protein  50.36 
 
 		 290 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.145429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1845  hypothetical protein  50.36 
 
 		 290 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1664  hypothetical protein  50.36 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2480  hypothetical protein  50 
 
 		 290 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1806  hypothetical protein  50 
 
 		 285 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2496  hypothetical protein  49.24 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.296365  hitchhiker  0.00398106 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2306  hypothetical protein  49.05 
 
 		 290 aa  278  8e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300856  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2711  hypothetical protein  49.24 
 
 		 290 aa  278  9e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2376  hypothetical protein  49.05 
 
 		 290 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.284586  normal  0.912373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1455  hypothetical protein  46.21 
 
 		 282 aa  275  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2384  hypothetical protein  30 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01920  hypothetical protein  30.77 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0403561  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3305  rare lipoprotein A  27.96 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.40538  normal  0.056072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2199  putative lipoprotein  26.86 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2527  hypothetical protein  27.06 
 
 		 256 aa  102  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0577  hypothetical protein  26.64 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05383  hypothetical protein  26.67 
 
 		 286 aa  99.4  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0335  putative lipoprotein  24.91 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.91114  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3865  lipoprotein  25.45 
 
 		 286 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3789  putative lipoprotein  23.91 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0227546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1589  lipoprotein, putative  24.64 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4075  lipoprotein  22.22 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000507  hypothetical protein  23.48 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4564  putative lipoprotein  22.58 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1443  putative lipoprotein  23.37 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1325  hypothetical protein  22.58 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1382  hypothetical protein  24.91 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300588  normal  0.327464 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0585  hypothetical protein  22.14 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0556  putative lipoprotein  24.62 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.921395  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0228  hypothetical protein  25.4 
 
 		 374 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>