More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1304 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1304  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
334 aa  685    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.82 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0868  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  34.89 
 
 
335 aa  192  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.730901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1107  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.8 
 
 
329 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1442  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.43 
 
 
357 aa  184  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2275  NADPH dehydrogenase NamA  36.62 
 
 
340 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000882972  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3281  NADPH dehydrogenase NamA  34.14 
 
 
345 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1843  NADPH dehydrogenase NamA  34.46 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1893  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.53 
 
 
341 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  35.94 
 
 
650 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2028  NADPH dehydrogenase NamA  34.44 
 
 
345 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1891  NADPH dehydrogenase NamA  33.54 
 
 
345 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2038  NADPH dehydrogenase NamA  33.54 
 
 
345 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2070  NADPH dehydrogenase NamA  34.15 
 
 
345 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2106  NADPH dehydrogenase NamA  33.85 
 
 
345 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1853  NADPH dehydrogenase NamA  33.23 
 
 
345 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2139  NADPH dehydrogenase NamA  33.85 
 
 
345 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0771  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.16 
 
 
330 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0350  NADPH dehydrogenase NamA  35.69 
 
 
340 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.44 
 
 
387 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0121  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.92 
 
 
367 aa  176  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0011  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.54 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0271468  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1529  NADPH dehydrogenase NamA  34.44 
 
 
346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1888  NADPH dehydrogenase NamA  34.05 
 
 
345 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0520303  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1649  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.24 
 
 
365 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1392  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.69 
 
 
347 aa  170  4e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0980  NADH peroxidase  32.22 
 
 
360 aa  170  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.29 
 
 
369 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.23 
 
 
775 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  33.83 
 
 
774 aa  169  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.64 
 
 
364 aa  169  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0870  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.33 
 
 
340 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2193  NADH oxidase  33.43 
 
 
637 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  33.83 
 
 
777 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4410  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.33 
 
 
374 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00186263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.14 
 
 
776 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3330  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  31.37 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2970  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35 
 
 
404 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.790644 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  34.63 
 
 
790 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.2 
 
 
370 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1573  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.56 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  34.64 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.2 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  33.83 
 
 
359 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.33 
 
 
356 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2818  NADH peroxidase  31.34 
 
 
365 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.609535  normal  0.162723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0123  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.82 
 
 
374 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00317178  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.15 
 
 
354 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.73 
 
 
361 aa  162  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0533  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.43 
 
 
333 aa  161  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  34.04 
 
 
368 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  34.33 
 
 
790 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.65 
 
 
646 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  31.44 
 
 
771 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2520  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.91 
 
 
364 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984471  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1709  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.44 
 
 
369 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.069385  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4435  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.86 
 
 
355 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1495  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.63 
 
 
364 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.03 
 
 
368 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.23 
 
 
654 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.04 
 
 
387 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427162  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  33.14 
 
 
790 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  32.74 
 
 
792 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.71 
 
 
364 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  32.74 
 
 
792 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  32.42 
 
 
791 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.33 
 
 
368 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  34.27 
 
 
822 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.64 
 
 
652 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000750697  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1087  NADH:flavin oxidoreductase  31.37 
 
 
365 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0472  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.98 
 
 
344 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.73 
 
 
354 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.818781  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2709  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.48 
 
 
414 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2699  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.53 
 
 
418 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3994  putative FMN oxidoreductase  33.43 
 
 
411 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  33.14 
 
 
761 aa  156  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2864  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.63 
 
 
364 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597938  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4065  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.52 
 
 
414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1514  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.52 
 
 
645 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  33.73 
 
 
785 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.33 
 
 
364 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.438588  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3456  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.52 
 
 
414 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2994  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.23 
 
 
418 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135247  normal  0.163321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  35.76 
 
 
778 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2220  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.88 
 
 
370 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.708176  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2296  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.88 
 
 
370 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.559957  normal  0.67017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29030  putative FMN oxidoreductase  33.33 
 
 
411 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106505 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1700  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.52 
 
 
411 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.167604  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1244  NADH oxidase  32.44 
 
 
343 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3010  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.04 
 
 
364 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.43 
 
 
368 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.1 
 
 
373 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.23 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.39 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4091  flavine mononucleotide (FMN) oxidoreductase  35.29 
 
 
420 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.16 
 
 
407 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3913  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.19 
 
 
363 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.43 
 
 
368 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.34 
 
 
356 aa  152  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2008  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.21 
 
 
411 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.584547  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>