More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0060 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0060  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 263 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.545012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2130  dihydropteroate synthase  52.14 
 
 		 273 aa  268  8.999999999999999e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.202113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0090  dihydropteroate synthase type-2  52.12 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0047  dihydropteroate synthase 2  52.12 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0005  dihydropteroate synthase  52.12 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0127  dihydropteroate synthase type-2  52.12 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1582  dihydropteroate synthase  43.18 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0972411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0151  dihydropteroate synthase  43.18 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5341  dihydropteroate synthase  43.3 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  41.22 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  39.85 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  40.53 
 
 		 271 aa  184  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1263  dihydropteroate synthase  35.82 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  38.08 
 
 		 280 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  33.71 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  38.08 
 
 		 316 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  35.25 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  39.08 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  37.6 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  36.43 
 
 		 397 aa  172  5.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  36.54 
 
 		 291 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0945  dihydropteroate synthase  39.16 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  33.71 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  36.92 
 
 		 286 aa  169  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1476  dihydropteroate synthase  35.5 
 
 		 283 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  38.37 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  35.5 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  35.5 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  37.26 
 
 		 400 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  37.02 
 
 		 394 aa  168  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  36.15 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  36.02 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  36.05 
 
 		 412 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  36.78 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  36.02 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  35.5 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  37.26 
 
 		 277 aa  165  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0210  dihydropteroate synthase  35.34 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  38.64 
 
 		 307 aa  165  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  35.23 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 		 277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1932  dihydropteroate synthase  32.06 
 
 		 392 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36752  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  33.58 
 
 		 300 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  36.29 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  36.78 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  38.08 
 
 		 435 aa  162  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2028  dihydropteroate synthase  35.91 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  35.85 
 
 		 298 aa  162  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  32.57 
 
 		 294 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  35.25 
 
 		 282 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  35.25 
 
 		 282 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  35.25 
 
 		 282 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  35.25 
 
 		 282 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  35.25 
 
 		 282 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  35.6 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  35.25 
 
 		 282 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2187  dihydropteroate synthase  36.15 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.999142  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  35.25 
 
 		 282 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  35.25 
 
 		 282 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  36.78 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  35.8 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  36.78 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  36.78 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  36.78 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  36.78 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  35.69 
 
 		 282 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  36.78 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  34.62 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  34.87 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  34.75 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  34.75 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  33.72 
 
 		 278 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1513  dihydropteroate synthase  35.71 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  33.72 
 
 		 278 aa  158  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  37.02 
 
 		 298 aa  158  7e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  35.88 
 
 		 280 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  35.77 
 
 		 286 aa  158  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0572  dihydropteroate synthase  35.71 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  35.61 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0778  dihydropteroate synthase  35.71 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  35.38 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0579  dihydropteroate synthase  35.71 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.601672  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2775  dihydropteroate synthase  34.98 
 
 		 332 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0570609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  36.02 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1289  dihydropteroate synthase  35.71 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  36.02 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1483  dihydropteroate synthase  35.34 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  34.87 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  35.2 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1616  dihydropteroate synthase  35.34 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.282934  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  34.87 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  34.87 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  36.64 
 
 		 287 aa  156  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  34.87 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  33.72 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0111  dihydropteroate synthase  32.56 
 
 		 490 aa  156  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.119932 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  36.84 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>