25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1099 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1099  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0156489 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2228  hypothetical protein  41.46 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0103157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  38.78 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1029  putative bacteriophage protein  69.84 
 
 		 246 aa  93.2  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1386  terminase small subunit  44.59 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000898138  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0406  hypothetical protein  50 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.64186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  43.37 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2484  hypothetical protein  45.59 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.909373  normal  0.0282685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  40.23 
 
 		 164 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1585  hypothetical protein  44.12 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0364384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  43.9 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  41.46 
 
 		 199 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  36.96 
 
 		 193 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0245  cell-division initiation protein DivIVA  56.41 
 
 		 255 aa  54.3  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.106581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  26.67 
 
 		 192 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  32.18 
 
 		 184 aa  53.5  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  48.33 
 
 		 233 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3520  hypothetical protein  51.16 
 
 		 268 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894866  hitchhiker  0.00111857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  36.73 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  42.11 
 
 		 177 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1080  hypothetical protein  26.02 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  33.33 
 
 		 170 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  33.33 
 
 		 170 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  29.93 
 
 		 183 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  34.67 
 
 		 147 aa  43.9  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>