More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2247 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2247  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 272 aa  563  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  76.83 
 
 		 266 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3225  enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.85 
 
 		 279 aa  424  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2830  enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.75 
 
 		 290 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.37 
 
 		 290 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2975  enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.19 
 
 		 289 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.517707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1456  enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.96 
 
 		 279 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1528  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  76.14 
 
 		 293 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.837237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2799  enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.19 
 
 		 292 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2729  enoyl-CoA hydratase/isomerase  77.07 
 
 		 270 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1670  methylglutaconyl-CoA hydratase  76.83 
 
 		 286 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2396  methylglutaconyl-CoA hydratase  77.47 
 
 		 286 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1717  enoyl-CoA hydratase/isomerase  74.9 
 
 		 288 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1895  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  76.28 
 
 		 288 aa  407  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2324  methylglutaconyl-CoA hydratase  77.08 
 
 		 281 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  70.87 
 
 		 276 aa  367  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.65 
 
 		 281 aa  278  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  53.47 
 
 		 260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.74 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.62 
 
 		 269 aa  259  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  49.8 
 
 		 279 aa  251  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.24 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3664  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 		 271 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705793  hitchhiker  0.000000000357336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4066  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 		 271 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1775  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 		 271 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  hitchhiker  0.0077103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1810  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  49.39 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404881  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2468  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  50.4 
 
 		 291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.680829  normal  0.0128185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3658  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  50 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551488  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2031  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 		 266 aa  241  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  46.96 
 
 		 265 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  46.96 
 
 		 265 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2737  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  49.8 
 
 		 282 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1601  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45.32 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 		 266 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  45.25 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  45.63 
 
 		 264 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  47.22 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  44.88 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  47.64 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  45.02 
 
 		 268 aa  228  5e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  43.73 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  44.22 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.33 
 
 		 262 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.82 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  44.05 
 
 		 258 aa  221  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49530  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  49.4 
 
 		 264 aa  221  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  43.9 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.43 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.32 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 		 273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00100  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 		 265 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0191435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  43.09 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.5 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  43.09 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 		 262 aa  208  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  42.68 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1071  methylglutaconyl-CoA hydratase  41.41 
 
 		 256 aa  205  8e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0963  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.41 
 
 		 256 aa  205  8e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.39 
 
 		 261 aa  204  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1515  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.79 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.320841  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1792  hypothetical protein  45.28 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  44.72 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1791  hypothetical protein  45.67 
 
 		 276 aa  202  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  40.7 
 
 		 261 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.87 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0090  enoyl-CoA hydratase  44.14 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4353  enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.32 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5238  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  normal  0.97533 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5034  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3129  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114745  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1150  enoyl-CoA hydratase  42.17 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2941  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0701777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1507  enoyl-CoA hydratase  45.16 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20368  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  42.68 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0383  enoyl-CoA hydratase  41.87 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0361289  hitchhiker  0.00761881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0750  enoyl-CoA hydratase  42.51 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4586  enoyl-CoA hydratase  42.74 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1631  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.65 
 
 		 276 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0595398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0223  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 		 265 aa  185  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4528  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 		 266 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0222933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 		 266 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5119  enoyl-CoA hydratase  42.34 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>