More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1963 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1963  ribosomal protein L22  100 
 
 		 110 aa  217  3.9999999999999997e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0617879  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1028  50S ribosomal protein L22  77.98 
 
 		 110 aa  180  6e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000806813  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0064  50S ribosomal protein L22  79.05 
 
 		 124 aa  173  6e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000282721  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1699  50S ribosomal protein L22  79.09 
 
 		 147 aa  173  7e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000199803  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0039  50S ribosomal protein L22  77.06 
 
 		 110 aa  172  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00472535  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0089  50S ribosomal protein L22  73.15 
 
 		 109 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0769345  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1870  50S ribosomal protein L22  77.27 
 
 		 141 aa  170  5e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2076  50S ribosomal protein L22  76.36 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000614651  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0291  50S ribosomal protein L22  73.53 
 
 		 105 aa  157  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00371339  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2324  ribosomal protein L22  75 
 
 		 85 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000160012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  50.49 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  48.6 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0665  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  50.96 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  49.06 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  49.52 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  50.48 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  49.53 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  47.01 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  46.73 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  44.76 
 
 		 119 aa  92  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3007  50S ribosomal protein L22P  44.76 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148134  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  45.19 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1760  50S ribosomal protein L22  46.73 
 
 		 112 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0923883  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  48.6 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  48.6 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  46.3 
 
 		 111 aa  90.5  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  45.37 
 
 		 114 aa  90.1  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1280  ribosomal protein L22  48.54 
 
 		 110 aa  90.1  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2060  ribosomal protein L22  47.12 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000300396  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1916  50S ribosomal protein L22  48.6 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.58558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0693  50S ribosomal protein L22  45.22 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.411882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  47.17 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  43.97 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  44.76 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  45.13 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0298  ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.495087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  45.28 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  43.24 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  45.3 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  43.24 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  45.37 
 
 		 115 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  46.6 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  87  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  48.54 
 
 		 113 aa  86.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  45.05 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  46.67 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  45.28 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  45.71 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  49.51 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  40.91 
 
 		 281 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2164  ribosomal protein L22  44.76 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.135391 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  47.57 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  41.67 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  46.08 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  43.56 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  43.56 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17351  50S ribosomal protein L22  42.59 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  40.78 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  40.17 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 113 aa  84.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  47 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  43.81 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0342  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000162922  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1849  50S ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000192046  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  42.48 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2023  50S ribosomal protein L22  42.06 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.734149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1941  50S ribosomal protein L22  42.06 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  41.12 
 
 		 118 aa  83.6  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1938  50S ribosomal protein L22  42.06 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  40.17 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 114 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0410  50S ribosomal protein L22P  45.19 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0328  ribosomal protein L22  43.81 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000246157  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  45.54 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  43.81 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  44.76 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  46.53 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  39.82 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  45 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  44.55 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  44.34 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  44.55 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>