More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1954 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1954  ribosomal protein S8  100 
 
 
131 aa  265  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0048  30S ribosomal protein S8  78.63 
 
 
131 aa  223  7e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.580266  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0073  30S ribosomal protein S8  77.86 
 
 
131 aa  221  2e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.200652  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1690  30S ribosomal protein S8  77.1 
 
 
131 aa  218  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0798562  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1861  30S ribosomal protein S8  76.34 
 
 
131 aa  218  3e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2067  30S ribosomal protein S8  76.34 
 
 
131 aa  215  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1763  30S ribosomal protein S8  69.47 
 
 
131 aa  202  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00017341  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0098  30S ribosomal protein S8  67.18 
 
 
131 aa  196  6e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.578211  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0300  30S ribosomal protein S8  72.52 
 
 
131 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.110485  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1019  30S ribosomal protein S8  68.42 
 
 
114 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000503612  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  47.33 
 
 
132 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  43.51 
 
 
131 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 
132 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0491  ribosomal protein S8  45.04 
 
 
131 aa  121  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.263273  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  46.15 
 
 
134 aa  120  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  46.56 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  43.51 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
132 aa  117  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  45.8 
 
 
132 aa  117  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
131 aa  116  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  41.41 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  42.75 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  40.46 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000455878  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  40.46 
 
 
131 aa  115  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283482  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  42.31 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  45.74 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  42.31 
 
 
132 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000497619  decreased coverage  0.00000000000124793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000354136  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  40 
 
 
132 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  41.54 
 
 
132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
132 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
132 aa  114  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  40.77 
 
 
133 aa  114  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
132 aa  114  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000315626  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0195  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.344258  normal  0.96211 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  43.51 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3429  SSU ribosomal protein S8P  44.19 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401313  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  45.38 
 
 
131 aa  111  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2215  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
131 aa  110  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000186287  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  43.41 
 
 
131 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  0.000000826655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2605  30S ribosomal protein S8  40.46 
 
 
131 aa  110  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000206402  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  43.85 
 
 
131 aa  110  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  43.41 
 
 
131 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000196614  hitchhiker  0.00000244921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  41.54 
 
 
132 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  43.41 
 
 
131 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  40 
 
 
133 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1751  30S ribosomal protein S8  43.51 
 
 
126 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327993  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  43.41 
 
 
131 aa  110  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  39.69 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  41.54 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1147  ribosomal protein S8  40.77 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000686706  hitchhiker  0.00453997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  42.64 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  42.64 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  40.46 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  39.23 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0503  30S ribosomal protein S8  41.27 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  40 
 
 
132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  40 
 
 
133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  40 
 
 
132 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  39.23 
 
 
132 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  40.46 
 
 
132 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0067  30S ribosomal protein S8  42.64 
 
 
131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000554251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0303  30S ribosomal protein S8  41.54 
 
 
131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.20005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
132 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
132 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0781  ribosomal protein S8  42.52 
 
 
131 aa  107  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000256719  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  39.23 
 
 
130 aa  107  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1036  30S ribosomal protein S8  41.86 
 
 
131 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000159627  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  38.46 
 
 
132 aa  107  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0781  30S ribosomal protein S8  40 
 
 
132 aa  107  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00525969  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  41.22 
 
 
131 aa  107  6e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  41.54 
 
 
132 aa  107  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  37.69 
 
 
133 aa  106  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  42.52 
 
 
131 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000752194  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1837  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
131 aa  106  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3324  30S ribosomal protein S8  42.52 
 
 
131 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2155  ribosomal protein S8  41.98 
 
 
130 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0746711  normal  0.328935 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  39.69 
 
 
132 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  38.64 
 
 
136 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0299  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
130 aa  106  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.541435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>