More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1837 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1837  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 131 aa  262  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247256  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0303  30S ribosomal protein S8  91.6 
 
 		 131 aa  246  8e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.20005  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2409  30S ribosomal protein S8  87.79 
 
 		 131 aa  239  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017474  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0195  30S ribosomal protein S8  88.55 
 
 		 131 aa  238  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.344258  normal  0.96211 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2215  30S ribosomal protein S8  86.26 
 
 		 131 aa  233  5.0000000000000005e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000186287  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2282  30S ribosomal protein S8  79.23 
 
 		 131 aa  221  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000228338  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2050  30S ribosomal protein S8  76.15 
 
 		 131 aa  193  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00419842  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  133  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 132 aa  127  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  50 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  49.23 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  49.24 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  50 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 134 aa  124  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1263  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  50.76 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  46.27 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2310  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0172  30S ribosomal protein S8  47.33 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000595155  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1853  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 133 aa  120  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.923356 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0472  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 		 133 aa  120  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2980  30S ribosomal protein S8  46.62 
 
 		 132 aa  120  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  47.37 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2674  30S ribosomal protein S8  44.36 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.169773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1690  30S ribosomal protein S8  48.46 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0798562  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0616  ribosomal protein S8  48.46 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1861  30S ribosomal protein S8  48.46 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  45.11 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 		 131 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 		 130 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0073  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.200652  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3935  ribosomal protein S8  45.74 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  44.36 
 
 		 133 aa  115  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08990  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000305934  normal  0.17912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5773  ribosomal protein S8  46.15 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142927  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  44.62 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  43.7 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1339  30S ribosomal protein S8  43.94 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0064  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237116  hitchhiker  9.24625e-17 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  44.7 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  43.94 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2067  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0851  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 189 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000583772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5065  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 130 aa  114  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000451262  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1721  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.518742  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0733  30S ribosomal protein S8  43.94 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00108537  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  47.73 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0265  ribosomal protein S8  43.94 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3745  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380848  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0491  ribosomal protein S8  43.85 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.263273  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0245  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  46.21 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  43.18 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0213  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000264343  unclonable  0.0000000000147865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0208  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000167533  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0213  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0468  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00000537928  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0501  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000611084  normal  0.097534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  45.59 
 
 		 136 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0498  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000149249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4735  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 130 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000117347  normal  0.480985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  40.91 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>