45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0785 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0785  AAA ATPase  100 
 
 
399 aa  805    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.313428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4144  AAA ATPase  38.35 
 
 
429 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0805  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase; type iidhqase)  39.33 
 
 
399 aa  256  6e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.939667  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2166  AAA ATPase  39.25 
 
 
413 aa  241  1e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0547  hypothetical protein  33.42 
 
 
398 aa  224  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  33.99 
 
 
401 aa  202  7e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  33.25 
 
 
401 aa  196  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1506  AAA ATPase  29.07 
 
 
387 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.235855  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1555  AAA ATPase  27.66 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.536767  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  30.45 
 
 
477 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  27.75 
 
 
477 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.09 
 
 
485 aa  67.4  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25 
 
 
506 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.43 
 
 
486 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  33.52 
 
 
487 aa  63.2  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  23.35 
 
 
388 aa  63.2  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.36 
 
 
476 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  26.03 
 
 
392 aa  60.1  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  25.08 
 
 
402 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  24.05 
 
 
400 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  25 
 
 
431 aa  58.2  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  26.19 
 
 
378 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  25.09 
 
 
481 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  23.01 
 
 
379 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.62 
 
 
393 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  30.15 
 
 
543 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  30.15 
 
 
543 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  24.91 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  25.32 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  25.66 
 
 
423 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  25.66 
 
 
423 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  27.57 
 
 
486 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  22.76 
 
 
388 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  24.2 
 
 
426 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  22.92 
 
 
376 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  25 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  24.15 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  20.96 
 
 
394 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  22.49 
 
 
427 aa  47.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1375  hypothetical ATPase  30.22 
 
 
460 aa  46.6  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0409041  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1435  hypothetical protein  30.22 
 
 
460 aa  46.6  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  23.66 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  22.26 
 
 
466 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  28.57 
 
 
377 aa  43.1  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  25.24 
 
 
410 aa  43.1  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>