252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1857 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2871  peptidase M16C associated domain-containing protein  38.39 
 
 		 987 aa  637    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000230302  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1478  Peptidase M16C associated domain protein  51.55 
 
 		 970 aa  1009    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1842  peptidase M16 familiy  40.65 
 
 		 1024 aa  711    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.284572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2076  peptidase M16-like  56.39 
 
 		 983 aa  1092    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0673  metalloprotease  39.69 
 
 		 985 aa  668    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223334  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1130  peptidase M16-like  53.35 
 
 		 970 aa  1053    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.827511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1857  putative metalloprotease  100 
 
 		 983 aa  2045    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2129  peptidase M16-like  40.77 
 
 		 1025 aa  719    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1843  peptidase M16C associated domain-containing protein  42.91 
 
 		 1032 aa  741    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000453364  unclonable  0.00000000218752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4245  peptidase M16C associated domain-containing protein  55.45 
 
 		 973 aa  1113    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157444  hitchhiker  0.0000000002425 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2936  peptidase M16C associated domain-containing protein  49.95 
 
 		 967 aa  933    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0337172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1885  peptidase M16C associated domain-containing protein  55.56 
 
 		 974 aa  1085    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1643  peptidase M16C associated  39.94 
 
 		 972 aa  615  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  normal  0.901695 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32286  predicted protein  36.79 
 
 		 1034 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.414837  normal  0.522406 
 
 
-
 
NC_002620  TC0211  insulinase family metalloprotease  33.4 
 
 		 975 aa  489  1e-137  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2044  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.1 
 
 		 964 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1365  Peptidase M16C associated domain protein  32.52 
 
 		 968 aa  459  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0158  peptidase M16C associated domain-containing protein  31.67 
 
 		 968 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471453 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2677  PreP peptidase  31.15 
 
 		 1046 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1661  peptidase M16C associated domain-containing protein  31.89 
 
 		 976 aa  452  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1780  Peptidase M16C associated domain protein  34.04 
 
 		 969 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126781  normal  0.432438 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41654  predicted protein  30.74 
 
 		 979 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00193617  normal  0.306826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0695  peptidase M16C associated domain-containing protein  31.88 
 
 		 968 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00570537  decreased coverage  0.000127809 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0345  Peptidase M16C associated domain protein  30.44 
 
 		 970 aa  439  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0396626  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03853  Mitochondrial presequence protease Precursor (EC 3.4.24.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6H7]  33.17 
 
 		 1049 aa  430  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1565  Peptidase M16C associated domain protein  31.31 
 
 		 968 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0498145  normal  0.0547201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0490  Peptidase M16C associated domain protein  29.78 
 
 		 969 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_232  predicted protein  29.4 
 
 		 986 aa  399  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1865  M16 family peptidase  29.31 
 
 		 1017 aa  394  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000469623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1179  peptidase M16C associated  29.53 
 
 		 987 aa  395  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76282  predicted protein  29.95 
 
 		 1046 aa  395  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.967871  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0645  peptidase M16C associated domain-containing protein  29.07 
 
 		 992 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1656  putative peptidase  28.18 
 
 		 973 aa  364  4e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0884161  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1395  peptidase, putative  27.9 
 
 		 973 aa  363  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131852  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1217  Peptidase M16C associated domain protein  28.48 
 
 		 999 aa  340  7e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00171078  normal  0.0476077 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0378  Peptidase M16C associated domain protein  28.66 
 
 		 1010 aa  340  9.999999999999999e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.858415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0197  Peptidase M16C associated domain protein  27.24 
 
 		 949 aa  321  3.9999999999999996e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04570  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  27.64 
 
 		 985 aa  313  1e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0233  peptidase M16 inactive domain protein  25.88 
 
 		 971 aa  305  3.0000000000000004e-81  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.312549  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20700  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  27.7 
 
 		 972 aa  301  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2447  peptidase M16 domain protein  24.35 
 
 		 1137 aa  192  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04540  cytoplasm protein, putative  21.97 
 
 		 1054 aa  81.3  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0121322  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  30 
 
 		 937 aa  69.7  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  25.27 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  26.78 
 
 		 896 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84931  predicted protein  29.95 
 
 		 1049 aa  67.4  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.62 
 
 		 945 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09434  zinc metalloprotease, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07610)  22.61 
 
 		 1057 aa  63.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  23.35 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  24.28 
 
 		 448 aa  62  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  25.13 
 
 		 448 aa  62  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  25.13 
 
 		 448 aa  62  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  23.91 
 
 		 464 aa  61.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  23.38 
 
 		 461 aa  61.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  24.06 
 
 		 493 aa  60.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  23.37 
 
 		 853 aa  59.7  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  25.95 
 
 		 868 aa  58.9  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  22.03 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  24.46 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  27.36 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  22.65 
 
 		 454 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  28.8 
 
 		 459 aa  57.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  26.01 
 
 		 878 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  21.53 
 
 		 513 aa  57.4  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0931  peptidase M16 domain protein  24.43 
 
 		 405 aa  56.6  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  21.9 
 
 		 422 aa  56.6  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  23.78 
 
 		 464 aa  55.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  21.61 
 
 		 439 aa  56.2  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  28.98 
 
 		 460 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  23.06 
 
 		 489 aa  55.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  22.35 
 
 		 459 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  22.35 
 
 		 419 aa  55.1  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1147  peptidase M16 domain-containing protein  23.84 
 
 		 431 aa  55.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  22.82 
 
 		 462 aa  55.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  28.41 
 
 		 460 aa  55.1  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  28.41 
 
 		 460 aa  55.1  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  24.16 
 
 		 463 aa  54.7  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  25.95 
 
 		 949 aa  54.7  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6664  peptidase M16 domain protein  26.46 
 
 		 452 aa  54.7  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  22.35 
 
 		 419 aa  54.7  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  23.98 
 
 		 417 aa  54.3  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  22.36 
 
 		 443 aa  53.5  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3234  processing peptidase  23.91 
 
 		 421 aa  53.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  29.07 
 
 		 903 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  22.42 
 
 		 443 aa  53.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1582  peptidase M16 domain protein  22.64 
 
 		 434 aa  53.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157753  normal  0.0912908 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  23.35 
 
 		 443 aa  52.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  24.26 
 
 		 929 aa  53.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  24.26 
 
 		 949 aa  53.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  21.76 
 
 		 459 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3176  peptidase M16 domain-containing protein  22.12 
 
 		 453 aa  52.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  28.49 
 
 		 901 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  28.49 
 
 		 904 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  22.88 
 
 		 476 aa  52  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  27.78 
 
 		 431 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  25.82 
 
 		 918 aa  51.6  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0863  peptidase M16 domain protein  22.48 
 
 		 428 aa  52  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282828  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  21.71 
 
 		 466 aa  51.6  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0759  peptidase M16-like  21.56 
 
 		 430 aa  52  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  27.62 
 
 		 451 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>