More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1012 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1012  histidinol phosphate aminotransferase  100 
 
 
356 aa  730    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723593  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  34.38 
 
 
356 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27461  aminotransferases class-I  33.15 
 
 
377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2133  aminotransferase class-I  36.81 
 
 
367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02611  aminotransferases class-I  31.23 
 
 
371 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.620697  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02041  aminotransferase class-I  30.28 
 
 
376 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1553  histidinol phosphate aminotransferase  30.66 
 
 
371 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2450  histidinol phosphate aminotransferase  35.73 
 
 
372 aa  156  6e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.850065  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  31.89 
 
 
373 aa  153  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.61 
 
 
351 aa  152  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  30.08 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  31.27 
 
 
366 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  31.27 
 
 
366 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  30.83 
 
 
366 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  29.73 
 
 
366 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  31.71 
 
 
366 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  30.35 
 
 
366 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  31 
 
 
366 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  31 
 
 
366 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02151  aminotransferases class-I  30.09 
 
 
369 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  31 
 
 
366 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  30 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  27.89 
 
 
351 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  29.36 
 
 
355 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  31.91 
 
 
383 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0188  histidinol phosphate aminotransferase  30.29 
 
 
369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.057325  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  31.79 
 
 
392 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02061  aminotransferases class-I  30.57 
 
 
369 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  30.91 
 
 
358 aa  139  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  30.47 
 
 
370 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02041  aminotransferases class-I  30.86 
 
 
369 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0980416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.47 
 
 
370 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  30.47 
 
 
370 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  30.47 
 
 
370 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  27.61 
 
 
348 aa  139  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  32.73 
 
 
371 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  28.61 
 
 
371 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  31.16 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  30.97 
 
 
370 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  29.65 
 
 
370 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  30.93 
 
 
370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  29.01 
 
 
352 aa  135  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  29.01 
 
 
352 aa  135  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  30.39 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  31.72 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  27.93 
 
 
358 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  27.67 
 
 
358 aa  133  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  29.09 
 
 
360 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  30.52 
 
 
365 aa  133  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  32.26 
 
 
374 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  29.33 
 
 
370 aa  132  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  29.2 
 
 
358 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  27.93 
 
 
358 aa  132  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  31.49 
 
 
365 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  27.07 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  32.44 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  29.27 
 
 
370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  30.99 
 
 
359 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  28.45 
 
 
350 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  33 
 
 
356 aa  129  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2375  histidinol-phosphate aminotransferase  30.59 
 
 
356 aa  129  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.323647  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  27.27 
 
 
363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  31.27 
 
 
370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  30.08 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  28.81 
 
 
347 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  28.01 
 
 
347 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  29.35 
 
 
355 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  28.44 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  32.67 
 
 
356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  29.89 
 
 
357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  32.16 
 
 
365 aa  126  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  30.95 
 
 
353 aa  126  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  32.95 
 
 
370 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  31.31 
 
 
386 aa  126  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  33 
 
 
356 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  33 
 
 
356 aa  126  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0217  histidinol-phosphate aminotransferase  31.23 
 
 
366 aa  126  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  31.96 
 
 
374 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  31.29 
 
 
359 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  33 
 
 
365 aa  125  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  31.29 
 
 
359 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  31.29 
 
 
359 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  31.29 
 
 
359 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  31.97 
 
 
356 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  31.29 
 
 
359 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  32.67 
 
 
356 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  25.8 
 
 
371 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  31.56 
 
 
358 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  26.49 
 
 
374 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  28.86 
 
 
349 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  23.43 
 
 
371 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  30.41 
 
 
362 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  31.53 
 
 
357 aa  124  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
374 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  30.94 
 
 
364 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  28.25 
 
 
382 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  32.34 
 
 
356 aa  123  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  27.93 
 
 
358 aa  124  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  30.94 
 
 
364 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  27.63 
 
 
372 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>