48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1032 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1032  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 285 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.267396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1011  extracellular solute-binding protein  98.95 
 
 		 285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3328  extracellular solute-binding protein  94.76 
 
 		 286 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1044  extracellular solute-binding protein  93.71 
 
 		 286 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.523341 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2979  extracellular solute-binding protein  77.46 
 
 		 285 aa  461  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3247  extracellular solute-binding protein  75.66 
 
 		 285 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3146  extracellular solute-binding protein  74.53 
 
 		 285 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0876  extracellular solute-binding protein  74.53 
 
 		 285 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3307  extracellular solute-binding protein  54.87 
 
 		 286 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2915  extracellular solute-binding protein  52.8 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.418761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0704  putative amino acid-binding protein  37.04 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.440677  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3190  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 226 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0211783 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03935  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  35.14 
 
 		 229 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2793  putative amino acid-binding protein  34.05 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287982  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3620  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.2 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3196  hypothetical protein  32.89 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.144092 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.12 
 
 		 2213 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3998  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  33.48 
 
 		 241 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4021  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  33.48 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3920  putative amino acid-binding protein  31.28 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3921  extracellular solute-binding protein family 3  33.04 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4114  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  33.04 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1807  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3276  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  32.6 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0850  hypothetical protein  32.19 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000173614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0551  hypothetical protein  32.66 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.831394  decreased coverage  0.00317207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3588  hypothetical protein  26.75 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.623219  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1048  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems  27.54 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3267  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  29.65 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0627  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems  27.83 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.225445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1591  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.91 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.115336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2369  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  23.26 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  22.14 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.88 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  25 
 
 		 259 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  22.14 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  21.76 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  21.76 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  22.99 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  21.82 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  21.61 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  21.37 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  21.61 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.63 
 
 		 1047 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  23.46 
 
 		 260 aa  42.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  20.95 
 
 		 247 aa  42  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>