31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0376 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  100 
 
 
202 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  55.5 
 
 
208 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  36.61 
 
 
206 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  38.59 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  37.77 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  36.17 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  33.33 
 
 
221 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  34.39 
 
 
222 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  35.64 
 
 
225 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  35.6 
 
 
207 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  32.6 
 
 
220 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  32.64 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  32.64 
 
 
189 aa  92  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  92  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  32.81 
 
 
199 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  28.64 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  31.5 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  34.54 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  32.86 
 
 
220 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  30.92 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  31.96 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  31.77 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  31.88 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  32.61 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  31.88 
 
 
243 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  31.88 
 
 
243 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2681  hypothetical protein  32 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0631191  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2917  hypothetical protein  32.58 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000650535  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3439  hypothetical protein  32.58 
 
 
221 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0390.1  hypothetical protein  34.88 
 
 
161 aa  42  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>