44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4114 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3998  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  99.59 
 
 		 241 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3921  extracellular solute-binding protein family 3  99.59 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4114  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4021  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  99.17 
 
 		 241 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3276  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  51.8 
 
 		 247 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3190  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0211783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3620  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2915  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.418761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3307  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1044  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 286 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.523341 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2979  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1011  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3146  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3247  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2793  putative amino acid-binding protein  33.33 
 
 		 231 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3328  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 286 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0876  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 285 aa  118  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1032  extracellular solute-binding protein family 3  32.51 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.267396 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03935  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  34.6 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1807  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0704  putative amino acid-binding protein  31.71 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.440677  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3267  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  31.31 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1048  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems  28.57 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3196  hypothetical protein  31.94 
 
 		 322 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.144092 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.47 
 
 		 2213 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1591  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.71 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.115336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3920  putative amino acid-binding protein  28.46 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0551  hypothetical protein  26.36 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.831394  decreased coverage  0.00317207 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0850  hypothetical protein  27.64 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000173614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0627  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems  24.66 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.225445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3588  hypothetical protein  25.45 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.623219  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2369  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  25.44 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3673  putative cation efflux protein  28.63 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  26.32 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.31 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  25.93 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  23.89 
 
 		 276 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  20.55 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  23.01 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  25.53 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.2 
 
 		 1047 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  21.57 
 
 		 250 aa  42  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  22.45 
 
 		 245 aa  42  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>