43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2160 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2160  rhomboid family protein  100 
 
 		 198 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2270  Rhomboid family protein  94.44 
 
 		 198 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00653341  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4542  hypothetical protein  94.44 
 
 		 198 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2114  rhomboid family protein  93.94 
 
 		 198 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343017  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2256  rhomboid family protein  94.12 
 
 		 187 aa  346  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.18089  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1853  rhomboid family protein  92.43 
 
 		 188 aa  337  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124866  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2060  rhomboid family protein  80.41 
 
 		 204 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2165  rhomboid family protein  83.61 
 
 		 201 aa  316  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1915  rhomboid family protein  78.76 
 
 		 205 aa  315  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2504  hypothetical protein  76.8 
 
 		 204 aa  306  9e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1875  rhomboid family protein  61.11 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2350  rhomboid family protein  58.67 
 
 		 200 aa  217  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0538538  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2553  rhomboid family protein  60.64 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0621154  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2047  rhomboid family protein  68.32 
 
 		 171 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285623  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2016  rhomboid-like protein  54.35 
 
 		 218 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2063  rhomboid family protein  61.11 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1827  hypothetical protein  60.71 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02194  membrane protein, Rhomboid family  47.65 
 
 		 194 aa  151  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2148  rhomboid family membrane protein  44.25 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1088  integral membrane protein  46.45 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01423  hypothetical protein  48.25 
 
 		 162 aa  121  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0888  rhomboid family protein  42.58 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.86404 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004038  membrane protein  41.62 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.03896  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2522  rhomboid family membrane protein  40.53 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1567  hypothetical protein  43.45 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.018833  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0169  Rhomboid family protein  37.18 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0230  membrane protein, rhomboid family  37.33 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3112  rhomboid family protein  32.97 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2892  putative transmembrane protein  29.3 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2486  hypothetical protein  29.21 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1467  hypothetical protein  28.04 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4990  peptidase S54-type, rhomboid-like protein  34.44 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25145  normal  0.208438 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2655  hypothetical protein  32.28 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  31.85 
 
 		 242 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  29.65 
 
 		 282 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  28.16 
 
 		 238 aa  45.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  27.06 
 
 		 292 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  31.54 
 
 		 293 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0800  rhomboid family protein  30.12 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  28.97 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1033  rhomboid-like protein  28.83 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  27.75 
 
 		 279 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  24.56 
 
 		 289 aa  42.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>