More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3755 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3755  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3627  enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.93 
 
 		 214 aa  319  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270403  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1562  enoyl-CoA hydratase  54.8 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2158  enoyl-CoA hydratase  51.85 
 
 		 261 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1436  enoyl-CoA hydratase  53.28 
 
 		 269 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4618  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.91 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4683  enoyl-CoA hydratase  46.43 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5068  enoyl-CoA hydratase  46.43 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4769  enoyl-CoA hydratase  46.43 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0532353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1490  enoyl-CoA hydratase  46.85 
 
 		 251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5266  enoyl-CoA hydratase  47.64 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3981  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.2 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2352  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 		 253 aa  210  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0605839  normal  0.0748288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2803  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 		 248 aa  208  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72856  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3826  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.64 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2604  enoyl-CoA hydratase  43.09 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.888828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2065  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.09 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13583  enoyl-CoA hydratase  43.95 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1381  enoyl-CoA hydratase  43.28 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2743  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 		 253 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.92 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5876  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1532  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.383816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3752  enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6159  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.69 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1562  enoyl-CoA hydratase  31.49 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  31.71 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3088  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.6 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.2 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.65 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  29.8 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  29.67 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.89 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  28.75 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.59 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  28.85 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  30.12 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  30.65 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  30.4 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  28.11 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.22 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  28.11 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.76 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  28.11 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  28.11 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.06 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.4 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.08 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  28.86 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  28.86 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  28.11 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  28.86 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  28.33 
 
 		 260 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.46 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  28.86 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.68 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  27.2 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.2 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 		 268 aa  95.1  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  29.32 
 
 		 261 aa  95.1  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  29.72 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  28.92 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.2 
 
 		 659 aa  94.7  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.06 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  28.46 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  27.64 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.63 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.17 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.06 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  28.11 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.11 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  28.11 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  28.11 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.17 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  27.69 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0044  short chain enoyl-CoA hydratase  31.5 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  28.11 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  31.61 
 
 		 269 aa  92.8  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  28.11 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.67 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.86 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.35 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>