31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3555 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  41.27 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  38.52 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  43.41 
 
 		 172 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  31.85 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  43.41 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  35.86 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  37.9 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  37.9 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  42.06 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  42.06 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  42.06 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  35.77 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  36.13 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  34.88 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  41.46 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4111  hypothetical protein  36.96 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0961571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1145  protein of unknown function DUF35  29.57 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0574924  hitchhiker  0.0000746026 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  26.23 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  36.63 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  28.33 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3587  hypothetical protein  38.84 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  26.67 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  37.27 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  26.5 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3871  hypothetical protein  24.35 
 
 		 131 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  32.53 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3484  protein of unknown function DUF35  34.07 
 
 		 133 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>