20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3247 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3247  O-antigen polymerase  100 
 
 		 452 aa  875    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4815  O-antigen polymerase  31.81 
 
 		 466 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.629862  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1584  O-antigen polymerase  33.55 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.791545  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  27.47 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1503  binding-protein-dependent transport system protein  25.75 
 
 		 501 aa  55.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.200132  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  23.33 
 
 		 470 aa  54.3  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3039  putative binding-protein-dependent transport system protein  28 
 
 		 341 aa  53.9  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  26.76 
 
 		 502 aa  53.9  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  24.77 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 540 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  30.73 
 
 		 703 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  30.73 
 
 		 759 aa  47.4  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  25.29 
 
 		 452 aa  46.6  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  26.64 
 
 		 754 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  27.76 
 
 		 531 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1664  O-antigen polymerase  30.32 
 
 		 806 aa  44.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  33.04 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  28 
 
 		 438 aa  43.9  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  28.4 
 
 		 472 aa  43.9  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  29.44 
 
 		 607 aa  43.5  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>