More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1562 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1562  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 254 aa  517  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1532  enoyl-CoA hydratase  79.13 
 
 		 254 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.383816  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5876  enoyl-CoA hydratase  54.8 
 
 		 268 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6159  enoyl-CoA hydratase  52.17 
 
 		 258 aa  263  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  51 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3752  enoyl-CoA hydratase  53.2 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.43 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1436  enoyl-CoA hydratase  40.73 
 
 		 269 aa  154  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.22 
 
 		 651 aa  149  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1562  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 		 259 aa  148  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4618  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0655  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2352  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.29 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0605839  normal  0.0748288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2803  enoyl-CoA hydratase  37.34 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72856  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.32 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 		 255 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  33.58 
 
 		 255 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.84 
 
 		 255 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3826  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.7 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  33.58 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  36.69 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.69 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.69 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  36.69 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  31.91 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  36.69 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3981  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  36.69 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  36.69 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  37.1 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  36.69 
 
 		 297 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  36.69 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  36.29 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  36.69 
 
 		 297 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2158  enoyl-CoA hydratase  38.21 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  35.77 
 
 		 663 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.74 
 
 		 661 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  35.89 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.14 
 
 		 275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  35.08 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  36.29 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2604  enoyl-CoA hydratase  35.19 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.888828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 		 257 aa  131  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>