53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1051 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1051  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 475 aa  949    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0230  carbohydrate kinase FGGY  39.83 
 
 		 463 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5814  carbohydrate kinase FGGY  40.25 
 
 		 459 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6715  carbohydrate kinase FGGY  39.66 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6271  sugar kinase  40.59 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.918776  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3565  carbohydrate kinase FGGY  41.71 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2599  carbohydrate kinase, FGGY  37.18 
 
 		 456 aa  236  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2429  carbohydrate kinase  36.89 
 
 		 461 aa  213  7.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.850932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2207  carbohydrate kinase FGGY  38.76 
 
 		 483 aa  210  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.610278 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2184  putative carbohydrate kinase  36.45 
 
 		 515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2124  carbohydrate kinase, FGGY  38.78 
 
 		 493 aa  189  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0277297  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3634  carbohydrate kinase FGGY  29.08 
 
 		 482 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4893  carbohydrate kinase FGGY  28.87 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4213  carbohydrate kinase, FGGY  25 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212692  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1805  Sugar (pentulose and hexulose) kinase-like protein  28.39 
 
 		 474 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  26.3 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4923  carbohydrate kinase FGGY  29.65 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  27.48 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  27.48 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  28.94 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  27.16 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  27.16 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  27.16 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  27.16 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  27.16 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  27.16 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  27.64 
 
 		 485 aa  59.7  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  29.19 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  29.05 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  37.58 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  29.19 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  29.19 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  28.86 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  30.82 
 
 		 515 aa  54.3  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  28.98 
 
 		 528 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  27.24 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  30.94 
 
 		 473 aa  50.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  31.15 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0770  L-xylulose kinase  24.12 
 
 		 484 aa  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0048654  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  32.74 
 
 		 495 aa  48.5  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  23.9 
 
 		 485 aa  48.5  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  24.06 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  33.82 
 
 		 499 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  25.61 
 
 		 511 aa  47.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1655  carbohydrate kinase, FGGY  32.48 
 
 		 549 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0424957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  26.74 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5229  xylulose kinase  31.73 
 
 		 532 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  29.61 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  27.59 
 
 		 502 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2981  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.14 
 
 		 520 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3892  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  27.59 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2768  FGGY family of carbohydrate  25.64 
 
 		 388 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0823721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  29.87 
 
 		 498 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>