26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0180 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0180  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 800 aa  1586    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476576  hitchhiker  0.00129717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  45.2 
 
 		 737 aa  551  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1950  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.85 
 
 		 778 aa  204  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0899222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5025  hypothetical protein  32.28 
 
 		 481 aa  183  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898737  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5192  NTPase (NACHT family)-like protein  29.6 
 
 		 721 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0399  hypothetical protein  27.29 
 
 		 844 aa  154  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6778  hypothetical protein  32.12 
 
 		 670 aa  147  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1046 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.78 
 
 		 880 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.62 
 
 		 880 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8748  hypothetical protein  25.82 
 
 		 841 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3580  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.21 
 
 		 778 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26360  hypothetical protein  27.27 
 
 		 715 aa  72  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0427  hypothetical protein  37.88 
 
 		 276 aa  67  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0709  hypothetical protein  24.63 
 
 		 447 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.83 
 
 		 825 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3129  NACHT family-like NTPase  32.37 
 
 		 402 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554855  hitchhiker  0.000164305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 806 aa  52  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  43.33 
 
 		 187 aa  50.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  50.75 
 
 		 761 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0781  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 164 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0290139  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 816 aa  47  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  35.14 
 
 		 217 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  35.14 
 
 		 217 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  35.14 
 
 		 217 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 186 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>