179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3045 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3045  lacZ expression regulator  100 
 
 
279 aa  579  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.396256  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3233  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  75.27 
 
 
279 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.848486  hitchhiker  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0756  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  75.27 
 
 
279 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  hitchhiker  0.00582637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3901  lacZ expression regulator  75.27 
 
 
278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3329  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  75.27 
 
 
279 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.217792  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0728  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  75.27 
 
 
279 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.799636  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0809  Calcineurin phosphoesterase domain protein  72.4 
 
 
279 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  unclonable  0.00000000000233524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3575  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  72.4 
 
 
279 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0816  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  72.4 
 
 
279 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103731  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0771  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  73.48 
 
 
279 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0672533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0784  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  72.4 
 
 
279 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.611583  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0547  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  70.97 
 
 
279 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.352525  normal  0.353099 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3560  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  69.18 
 
 
279 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00638886  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0777  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  68.46 
 
 
279 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00052744  hitchhiker  0.00000000244618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4192  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  66.31 
 
 
279 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404354 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3222  metallophosphoesterase  60.22 
 
 
279 aa  363  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00294864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  41.58 
 
 
275 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  41.64 
 
 
276 aa  226  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  41.22 
 
 
275 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  40.5 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2010  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  44.85 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  40.14 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  39.34 
 
 
275 aa  215  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3364  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.12 
 
 
275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3536  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.12 
 
 
275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3434  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.12 
 
 
275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3441  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.12 
 
 
275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3369  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.12 
 
 
275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3358  cyclic AMP phosphodiesterase  38.35 
 
 
278 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0573033 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3210  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.12 
 
 
275 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.179691  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3496  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.12 
 
 
275 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4346  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.12 
 
 
275 aa  209  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3465  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.12 
 
 
275 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.481637  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02904  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.12 
 
 
275 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3327  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  43.12 
 
 
275 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.654688 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02854  hypothetical protein  43.12 
 
 
275 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0668  Calcineurin phosphoesterase domain protein  43.12 
 
 
275 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2672  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.8 
 
 
274 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  38.75 
 
 
271 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3445  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  40.86 
 
 
275 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00872  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.96 
 
 
268 aa  205  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  41.02 
 
 
280 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0317  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  40.96 
 
 
275 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0326  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  40.96 
 
 
275 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0665  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  42.75 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0159191 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004519  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  42.59 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16665  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  39.69 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  39.31 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  40.16 
 
 
259 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  37.36 
 
 
269 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  39.08 
 
 
256 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  37.4 
 
 
272 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0192  metallophosphoesterase  37.25 
 
 
270 aa  186  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  37.64 
 
 
268 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  37.4 
 
 
272 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4709  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  41.22 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.771801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4970  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  38.17 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4917  icc protein  37.79 
 
 
266 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  37.79 
 
 
266 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  35.97 
 
 
266 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  37.15 
 
 
266 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0372  icc protein  36.23 
 
 
271 aa  169  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  36 
 
 
266 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0277  metallophosphoesterase  35.32 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  31.23 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4178  cyclic AMP phosphodiesterase  33.47 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  34.78 
 
 
244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0534  putative ICC protein  30.27 
 
 
279 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2339  metallophosphoesterase  27.92 
 
 
279 aa  112  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2036  cyclic AMP phosphodiesterase  28.2 
 
 
279 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.065067 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0181  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.87 
 
 
340 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367464  hitchhiker  0.00819669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03687  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  27.72 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00113636  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0061  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  28.44 
 
 
237 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  31.6 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  27.41 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1772  ICC (3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase) protein  28.29 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131867  normal  0.0325302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  29.35 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  26.37 
 
 
276 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  25.98 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0433  metallophosphoesterase  28.12 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163527  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  27.03 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  26.19 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  29.5 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  29.5 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  27.5 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  29.5 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  25.79 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  25.5 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  25.11 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  26.29 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  24.15 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  26.79 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.76 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  25.67 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  26.13 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  25.48 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  24.87 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  25.1 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  25.36 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1191  metallophosphoesterase  27.1 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>