164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0433 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0433  metallophosphoesterase  100 
 
 
250 aa  523  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03687  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  32.97 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00113636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  33.07 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  31.1 
 
 
268 aa  121  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  32.94 
 
 
256 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.8 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  31.1 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  29.96 
 
 
266 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3358  cyclic AMP phosphodiesterase  27.67 
 
 
278 aa  115  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0573033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  30.31 
 
 
271 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.85 
 
 
275 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.46 
 
 
299 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  29.53 
 
 
275 aa  112  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.46 
 
 
275 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  31.13 
 
 
268 aa  111  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3901  lacZ expression regulator  29.07 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3560  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  28.68 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00638886  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3575  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.07 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0809  Calcineurin phosphoesterase domain protein  29.07 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  unclonable  0.00000000000233524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0784  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  29.07 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.611583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0816  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  29.07 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103731  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0277  metallophosphoesterase  28.79 
 
 
251 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0771  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.29 
 
 
279 aa  109  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0672533  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0756  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.29 
 
 
279 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  hitchhiker  0.00582637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0728  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.29 
 
 
279 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.799636  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  28.57 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  28.74 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3233  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.29 
 
 
279 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.848486  hitchhiker  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0777  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  30 
 
 
279 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00052744  hitchhiker  0.00000000244618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4192  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  30.38 
 
 
279 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404354 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  29.1 
 
 
280 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0192  metallophosphoesterase  29.88 
 
 
270 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  29.53 
 
 
272 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3222  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
279 aa  105  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00294864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  28.24 
 
 
266 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  29.13 
 
 
272 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2672  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  27.2 
 
 
274 aa  105  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  28.19 
 
 
265 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4970  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  29.6 
 
 
266 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4917  icc protein  29.6 
 
 
266 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4709  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  30 
 
 
267 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.771801 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0547  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  27.91 
 
 
279 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.352525  normal  0.353099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3329  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.12 
 
 
279 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.217792  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3045  lacZ expression regulator  28.12 
 
 
279 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.396256  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3364  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.43 
 
 
275 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3369  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.43 
 
 
275 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.2 
 
 
266 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3441  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.43 
 
 
275 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3434  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.43 
 
 
275 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3445  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.43 
 
 
275 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3536  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.43 
 
 
275 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0665  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.41 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0159191 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3465  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.08 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.481637  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4346  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.08 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3327  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.08 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.654688 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3210  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.08 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.179691  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3496  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.08 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02904  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.08 
 
 
275 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0668  Calcineurin phosphoesterase domain protein  30.08 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02854  hypothetical protein  30.08 
 
 
275 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0317  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.64 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  25.88 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0372  icc protein  27.91 
 
 
271 aa  92.8  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0326  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.25 
 
 
275 aa  92.4  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4178  cyclic AMP phosphodiesterase  26.44 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2010  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  29.8 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00872  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  28.85 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.19 
 
 
277 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  29.37 
 
 
244 aa  85.5  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004519  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  27.84 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16665  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  27.1 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  27.31 
 
 
277 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2036  cyclic AMP phosphodiesterase  26.12 
 
 
279 aa  79  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.065067 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  26.72 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  27.24 
 
 
278 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2339  metallophosphoesterase  26.58 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  29.09 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  27.87 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  24.49 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  25.59 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0181  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  28.95 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367464  hitchhiker  0.00819669 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  26.17 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  26.18 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0534  putative ICC protein  23.29 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1772  ICC (3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase) protein  28.14 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131867  normal  0.0325302 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  25.59 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  25.59 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0061  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.5 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  29.03 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  24.67 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  24.53 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  27.49 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  26.24 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  25.1 
 
 
286 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  23.19 
 
 
286 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  25.56 
 
 
274 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  23.42 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  24.66 
 
 
274 aa  58.9  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1191  metallophosphoesterase  24.6 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  25.62 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>