28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1610 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1610  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  798    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00290154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2211  NERD domain-containing protein  32.14 
 
 		 353 aa  133  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  32.85 
 
 		 267 aa  123  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  31.86 
 
 		 269 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  31.12 
 
 		 329 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  40.43 
 
 		 207 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  31.1 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  30.98 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  27.83 
 
 		 267 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  35.71 
 
 		 230 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  28.97 
 
 		 260 aa  103  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  27.88 
 
 		 355 aa  99.4  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1130  NERD domain-containing protein  32.68 
 
 		 199 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509839 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  30.85 
 
 		 259 aa  90.1  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  26.32 
 
 		 211 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  36 
 
 		 262 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  27.14 
 
 		 212 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  30.72 
 
 		 256 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  28.4 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1889  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.344159 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  27.27 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  28.97 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  27.22 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  27.22 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1109  hypothetical protein  32.71 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1888  hypothetical protein  27.52 
 
 		 245 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.349997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2594  NERD domain protein  22.54 
 
 		 311 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.173089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>