45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0638 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0638  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 459 aa  938    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.044891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0825  TPR repeat-containing protein  63.09 
 
 		 455 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0915  TPR repeat-containing protein  63.57 
 
 		 455 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0669152  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0837  TPR repeat-containing protein  63.76 
 
 		 469 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0936  TPR repeat-containing protein  63.19 
 
 		 466 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  normal  0.106042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1061  TPR domain-containing protein  62.97 
 
 		 466 aa  578  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3014  TPR repeat-containing protein  63.51 
 
 		 467 aa  578  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00235052  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0899  TPR repeat-containing protein  62.53 
 
 		 466 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3038  TPR repeat-containing protein  62.75 
 
 		 466 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000055247  normal  0.645895 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3600  TPR repeat-containing protein  62.03 
 
 		 467 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000996774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0885  TPR repeat-containing protein  61.81 
 
 		 467 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000189506  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  61.59 
 
 		 467 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0332171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3477  TPR repeat-containing protein  62.39 
 
 		 467 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0100527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0965  TPR repeat-containing protein  61.59 
 
 		 455 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2913  tetratricopeptide TPR_2  61.17 
 
 		 453 aa  561  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000006025  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3242  TPR repeat-containing protein  59.15 
 
 		 456 aa  551  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3949  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 		 487 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0598  putative lipoprotein  32.48 
 
 		 483 aa  195  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004002  putative lipoprotein  32.01 
 
 		 465 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01520  hypothetical protein  30.99 
 
 		 468 aa  181  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1296  putative lipoprotein  30.52 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1486  hypothetical protein  30.89 
 
 		 472 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00338852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5472  hypothetical protein  28.31 
 
 		 464 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2516  hypothetical protein  26.67 
 
 		 509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5471  hypothetical protein  26.11 
 
 		 457 aa  113  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0735646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0604  hypothetical protein  25.05 
 
 		 559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243924  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2263  hypothetical protein  25.67 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.156064  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0064  hypothetical protein  25.53 
 
 		 477 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0124  putative lipoprotein  24.24 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0084  putative lipoprotein  23.89 
 
 		 453 aa  87  7e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1193  hypothetical protein  24.73 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.01113  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1905  hypothetical protein  24.83 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1831  tetratricopeptide TPR_4  25.45 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0190  hypothetical protein  26.16 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2334  hypothetical protein  23.36 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000614425  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2066  hypothetical protein  25.57 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0714  hypothetical protein  25.68 
 
 		 554 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0179  conserved hypothetical lipoprotein  21.03 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1811  hypothetical protein  25.38 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0631  hypothetical protein  23.33 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.831891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1890  hypothetical protein  24.39 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1315  hypothetical protein  23.58 
 
 		 568 aa  64.3  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.297813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3852  hypothetical protein  21.41 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0082  hypothetical protein  23.55 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1668  hypothetical protein  23.48 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>