39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0064 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0064  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  975    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2334  hypothetical protein  44.47 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000614425  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1905  hypothetical protein  35.15 
 
 		 452 aa  293  5e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.88 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0332171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3014  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00235052  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1831  tetratricopeptide TPR_4  25.9 
 
 		 441 aa  127  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0885  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000189506  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1061  TPR domain-containing protein  26.39 
 
 		 466 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3600  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 467 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000996774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3477  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 467 aa  123  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0100527  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0190  hypothetical protein  23.06 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0936  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  normal  0.106042 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3038  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000055247  normal  0.645895 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0899  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3242  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 456 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0915  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0669152  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0825  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0598  putative lipoprotein  24.04 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2913  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000006025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0965  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0837  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 469 aa  105  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3949  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0714  hypothetical protein  24.16 
 
 		 554 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1811  hypothetical protein  24.77 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2066  hypothetical protein  24.78 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1890  hypothetical protein  24.55 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0638  TPR domain-containing protein  25.53 
 
 		 459 aa  100  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.044891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5472  hypothetical protein  24.9 
 
 		 464 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004002  putative lipoprotein  24.22 
 
 		 465 aa  87  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2516  hypothetical protein  24.9 
 
 		 509 aa  86.7  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219773 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1296  putative lipoprotein  23.41 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2263  hypothetical protein  23.4 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.156064  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1668  hypothetical protein  22.36 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1193  hypothetical protein  22.42 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.01113  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01520  hypothetical protein  23.58 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1486  hypothetical protein  24.32 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00338852  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0604  hypothetical protein  21.62 
 
 		 559 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243924  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5471  hypothetical protein  21.62 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0735646 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0124  putative lipoprotein  31.68 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>