32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1315 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0631  hypothetical protein  78.04 
 
 		 534 aa  794    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.831891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1315  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1163    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.297813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2516  hypothetical protein  33.33 
 
 		 509 aa  223  7e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0604  hypothetical protein  31.21 
 
 		 559 aa  195  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243924  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5472  hypothetical protein  30.34 
 
 		 464 aa  193  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5471  hypothetical protein  29.88 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0735646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1061  TPR domain-containing protein  24.85 
 
 		 466 aa  87.4  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3038  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000055247  normal  0.645895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0936  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  normal  0.106042 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.56 
 
 		 467 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0332171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0885  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000189506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3600  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000996774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3477  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0100527  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0899  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3014  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00235052  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0598  putative lipoprotein  23.25 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0965  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0837  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3949  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 487 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0825  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0638  TPR domain-containing protein  23.58 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.044891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2913  tetratricopeptide TPR_2  24.05 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000006025  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0190  hypothetical protein  20.94 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3242  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0915  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0669152  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01520  hypothetical protein  21.73 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1296  putative lipoprotein  21.5 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2334  hypothetical protein  21.53 
 
 		 461 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000614425  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1193  hypothetical protein  22.39 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.01113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004002  putative lipoprotein  20.28 
 
 		 465 aa  54.3  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0064  hypothetical protein  25.9 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0714  hypothetical protein  25.17 
 
 		 554 aa  45.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>