44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3242 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0899  TPR repeat-containing protein  68.47 
 
 		 466 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3477  TPR repeat-containing protein  68.36 
 
 		 467 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0100527  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3014  TPR repeat-containing protein  68.65 
 
 		 467 aa  664    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00235052  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0837  TPR repeat-containing protein  68.72 
 
 		 469 aa  641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0885  TPR repeat-containing protein  68.74 
 
 		 467 aa  653    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000189506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0915  TPR repeat-containing protein  67.19 
 
 		 455 aa  635    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0669152  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0825  TPR repeat-containing protein  67.91 
 
 		 455 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3600  TPR repeat-containing protein  68.96 
 
 		 467 aa  656    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000996774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3242  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 456 aa  934    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0936  TPR repeat-containing protein  67.34 
 
 		 466 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  normal  0.106042 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3038  TPR repeat-containing protein  67.12 
 
 		 466 aa  641    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000055247  normal  0.645895 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  68.58 
 
 		 467 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0332171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1061  TPR domain-containing protein  68.02 
 
 		 466 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0965  TPR repeat-containing protein  66.44 
 
 		 455 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2913  tetratricopeptide TPR_2  65.93 
 
 		 453 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000006025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0638  TPR domain-containing protein  59.15 
 
 		 459 aa  551  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.044891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3949  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 		 487 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0598  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 483 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004002  putative lipoprotein  29.69 
 
 		 465 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01520  hypothetical protein  28.76 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1296  putative lipoprotein  28.42 
 
 		 465 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1486  hypothetical protein  30.02 
 
 		 472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00338852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5472  hypothetical protein  27.98 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2516  hypothetical protein  22.84 
 
 		 509 aa  124  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219773 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0064  hypothetical protein  24.74 
 
 		 477 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0604  hypothetical protein  22.82 
 
 		 559 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243924  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1905  hypothetical protein  23.41 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1831  tetratricopeptide TPR_4  24.07 
 
 		 441 aa  103  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2066  hypothetical protein  26.93 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5471  hypothetical protein  24.48 
 
 		 457 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0735646 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1890  hypothetical protein  26.37 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1811  hypothetical protein  25.65 
 
 		 407 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2263  hypothetical protein  24.61 
 
 		 435 aa  91.3  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.156064  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2334  hypothetical protein  22.44 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000614425  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0124  putative lipoprotein  24.15 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0084  putative lipoprotein  24.15 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0179  conserved hypothetical lipoprotein  23.41 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0190  hypothetical protein  22.62 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1193  hypothetical protein  23.11 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.01113  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0631  hypothetical protein  22.19 
 
 		 534 aa  62  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.831891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3852  hypothetical protein  23.56 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0714  hypothetical protein  24.09 
 
 		 554 aa  57  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0082  hypothetical protein  21.75 
 
 		 504 aa  53.9  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1315  hypothetical protein  20.73 
 
 		 568 aa  53.1  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.297813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>