29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0714 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0714  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1141    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0064  hypothetical protein  24.16 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1905  hypothetical protein  25.39 
 
 		 452 aa  100  9e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0638  TPR domain-containing protein  25.68 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.044891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0915  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0669152  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0965  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 455 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0825  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1831  tetratricopeptide TPR_4  25.86 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2913  tetratricopeptide TPR_2  25.39 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000006025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0837  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1061  TPR domain-containing protein  24.68 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2334  hypothetical protein  25.78 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000614425  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0899  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 466 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3038  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 466 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000055247  normal  0.645895 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3014  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00235052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3949  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0936  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  normal  0.106042 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.01 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0332171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3600  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000996774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0885  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000189506  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1890  hypothetical protein  28.19 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1811  hypothetical protein  28.19 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3477  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0100527  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2066  hypothetical protein  28.11 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0190  hypothetical protein  22.08 
 
 		 434 aa  60.1  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3242  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 456 aa  57  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2516  hypothetical protein  29.77 
 
 		 509 aa  49.3  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219773 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0598  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 483 aa  47.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1315  hypothetical protein  25.17 
 
 		 568 aa  45.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.297813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>