42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1905 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1905  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  941    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2334  hypothetical protein  40.05 
 
 
461 aa  313  4.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000614425  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0064  hypothetical protein  35.15 
 
 
477 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1831  tetratricopeptide TPR_4  28.37 
 
 
441 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0598  putative lipoprotein  24.94 
 
 
483 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3242  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 
456 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0190  hypothetical protein  24.58 
 
 
434 aa  104  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01520  hypothetical protein  23.65 
 
 
468 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0714  hypothetical protein  25.39 
 
 
554 aa  100  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3949  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 
487 aa  99.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0965  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 
455 aa  97.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115055  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004002  putative lipoprotein  23.35 
 
 
465 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0899  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 
466 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307995  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3600  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 
467 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000996774  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2913  tetratricopeptide TPR_2  22.89 
 
 
453 aa  95.1  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000006025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0885  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 
467 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000189506  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.41 
 
 
467 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0332171  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3038  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 
466 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000055247  normal  0.645895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0936  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 
466 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  normal  0.106042 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3477  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 
467 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0100527  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3014  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 
467 aa  94.4  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00235052  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1811  hypothetical protein  23.19 
 
 
407 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0825  TPR repeat-containing protein  22.72 
 
 
455 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1890  hypothetical protein  22.95 
 
 
407 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2066  hypothetical protein  22.93 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1061  TPR domain-containing protein  22.43 
 
 
466 aa  91.3  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0915  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 
455 aa  90.5  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0669152  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0837  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 
469 aa  90.1  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1296  putative lipoprotein  23.18 
 
 
465 aa  86.7  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0638  TPR domain-containing protein  24.83 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.044891  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1486  hypothetical protein  22.43 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00338852  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2263  hypothetical protein  22.79 
 
 
435 aa  83.2  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.156064  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5472  hypothetical protein  21.18 
 
 
464 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1193  hypothetical protein  20.89 
 
 
457 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.01113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5471  hypothetical protein  20.27 
 
 
457 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0735646 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2516  hypothetical protein  21.82 
 
 
509 aa  59.7  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3852  hypothetical protein  26.11 
 
 
457 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0082  hypothetical protein  22.46 
 
 
504 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0604  hypothetical protein  26.21 
 
 
559 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243924  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0179  conserved hypothetical lipoprotein  20.7 
 
 
448 aa  51.6  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0084  putative lipoprotein  27.21 
 
 
453 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0124  putative lipoprotein  27.21 
 
 
453 aa  46.6  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>