47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2516 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2516  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1033    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5472  hypothetical protein  51.27 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5471  hypothetical protein  45.87 
 
 		 457 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0735646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0604  hypothetical protein  42.92 
 
 		 559 aa  339  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243924  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0631  hypothetical protein  33.2 
 
 		 534 aa  227  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.831891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1315  hypothetical protein  32.94 
 
 		 568 aa  213  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.297813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3949  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 487 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2913  tetratricopeptide TPR_2  26.73 
 
 		 453 aa  140  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000006025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0598  putative lipoprotein  25.77 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0638  TPR domain-containing protein  26.67 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.044891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3477  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0100527  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0936  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  normal  0.106042 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.96 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0332171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0885  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000189506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3600  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000996774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3038  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 		 466 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000055247  normal  0.645895 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0899  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 466 aa  125  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3242  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 		 456 aa  124  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1061  TPR domain-containing protein  25.31 
 
 		 466 aa  123  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3014  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 467 aa  120  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00235052  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0837  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0825  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0965  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 455 aa  106  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004002  putative lipoprotein  24.89 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0915  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0669152  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1193  hypothetical protein  23.01 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.01113  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1486  hypothetical protein  25.94 
 
 		 472 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00338852  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1296  putative lipoprotein  26.1 
 
 		 465 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01520  hypothetical protein  23.87 
 
 		 468 aa  90.9  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0064  hypothetical protein  24.9 
 
 		 477 aa  86.7  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0190  hypothetical protein  25 
 
 		 434 aa  86.7  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2334  hypothetical protein  23.97 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000614425  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3852  hypothetical protein  25.16 
 
 		 457 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2263  hypothetical protein  24.88 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.156064  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1811  hypothetical protein  23.22 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2066  hypothetical protein  23.27 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1890  hypothetical protein  22.99 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1668  hypothetical protein  25.51 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1831  tetratricopeptide TPR_4  24.66 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0124  putative lipoprotein  23.31 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2794  sporulation domain-containing protein  23.84 
 
 		 671 aa  67  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0179  conserved hypothetical lipoprotein  21.93 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0082  hypothetical protein  23.75 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0084  putative lipoprotein  23.54 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1905  hypothetical protein  21.82 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0714  hypothetical protein  29.77 
 
 		 554 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 		 681 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>