41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2263 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2263  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  892    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.156064  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1831  tetratricopeptide TPR_4  25.42 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3949  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0638  TPR domain-containing protein  25.43 
 
 		 459 aa  107  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.044891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2913  tetratricopeptide TPR_2  27.46 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000006025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.67 
 
 		 467 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0332171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0936  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 466 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  normal  0.106042 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0885  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 467 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000189506  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3477  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 467 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0100527  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3600  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 467 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000996774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3014  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 467 aa  96.7  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00235052  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0899  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 466 aa  96.3  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2334  hypothetical protein  23.36 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000614425  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0965  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1061  TPR domain-containing protein  24.28 
 
 		 466 aa  96.3  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3038  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 466 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000055247  normal  0.645895 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01520  hypothetical protein  24.23 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0825  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 455 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5472  hypothetical protein  24.59 
 
 		 464 aa  94  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0598  putative lipoprotein  24.16 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3242  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 456 aa  91.3  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0837  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 469 aa  89  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004002  putative lipoprotein  25.99 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0064  hypothetical protein  21.86 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2516  hypothetical protein  25.36 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219773 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1905  hypothetical protein  22.79 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0604  hypothetical protein  24.27 
 
 		 559 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243924  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0915  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0669152  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3852  hypothetical protein  21.29 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1486  hypothetical protein  22.95 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00338852  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0190  hypothetical protein  21.52 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1296  putative lipoprotein  23.53 
 
 		 465 aa  66.6  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2066  hypothetical protein  24.27 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1811  hypothetical protein  28.34 
 
 		 407 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1890  hypothetical protein  28.34 
 
 		 407 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0179  conserved hypothetical lipoprotein  21.75 
 
 		 448 aa  47.4  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1193  hypothetical protein  22.09 
 
 		 457 aa  47.4  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.01113  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0631  hypothetical protein  22.02 
 
 		 534 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.831891  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0084  putative lipoprotein  26.62 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0124  putative lipoprotein  25.97 
 
 		 453 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5471  hypothetical protein  21.22 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0735646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>