22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1668 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1668  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  956    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2066  hypothetical protein  27.01 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1811  hypothetical protein  27.02 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0064  hypothetical protein  22.36 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5472  hypothetical protein  23.3 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1890  hypothetical protein  26.26 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2516  hypothetical protein  25.51 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219773 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0190  hypothetical protein  22.08 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5471  hypothetical protein  24.43 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0735646 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2794  sporulation domain-containing protein  23.53 
 
 		 671 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0885  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000189506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3600  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000996774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3014  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 467 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00235052  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2334  hypothetical protein  24.02 
 
 		 461 aa  47.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000614425  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0604  hypothetical protein  23.65 
 
 		 559 aa  47  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243924  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.43 
 
 		 467 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0332171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0598  putative lipoprotein  28.91 
 
 		 483 aa  47  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1061  TPR domain-containing protein  23.48 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3477  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0100527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0638  TPR domain-containing protein  23.48 
 
 		 459 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.044891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1831  tetratricopeptide TPR_4  27.05 
 
 		 441 aa  43.9  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0899  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 466 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>