More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2010 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2010  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 346 aa  685    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0860436  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4023  rod shape-determining protein MreB  75.75 
 
 		 350 aa  498  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0492  rod shape-determining protein MreB  68.5 
 
 		 346 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152747  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1627  rod shape-determining protein MreB  67.25 
 
 		 348 aa  455  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2128  rod shape-determining protein MreB  66.47 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  65.23 
 
 		 342 aa  408  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  61.95 
 
 		 346 aa  408  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  63.06 
 
 		 346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  64.22 
 
 		 348 aa  404  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  65.23 
 
 		 346 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  60.64 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3645  rod shape-determining protein MreB  57.02 
 
 		 353 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0595  rod shape-determining protein MreB  57.88 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  57.61 
 
 		 348 aa  368  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4032  rod shape-determining protein MreB  55.1 
 
 		 366 aa  368  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  56.21 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  58.23 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  55.33 
 
 		 347 aa  362  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  56.42 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  56.42 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1258  rod shape-determining protein MreB  56.77 
 
 		 358 aa  360  2e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  56.93 
 
 		 345 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  56.93 
 
 		 345 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  55.16 
 
 		 347 aa  360  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  55.16 
 
 		 347 aa  360  3e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  56.93 
 
 		 345 aa  358  5e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0473  rod shape-determining protein MreB  59.09 
 
 		 348 aa  359  5e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.836992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  56.12 
 
 		 348 aa  358  7e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  55.33 
 
 		 347 aa  358  9e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  55.29 
 
 		 347 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  55.65 
 
 		 343 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  57.4 
 
 		 344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 		 348 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  55.66 
 
 		 346 aa  355  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  57.62 
 
 		 347 aa  355  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  57.41 
 
 		 347 aa  355  5e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  56.19 
 
 		 345 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  56.19 
 
 		 345 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  56.19 
 
 		 345 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  56.19 
 
 		 345 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  56.19 
 
 		 345 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  56.19 
 
 		 345 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  56.19 
 
 		 345 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  55.69 
 
 		 349 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  55.39 
 
 		 349 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  56.27 
 
 		 346 aa  354  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  54.28 
 
 		 343 aa  354  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  55.89 
 
 		 345 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  55.89 
 
 		 345 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  53.89 
 
 		 343 aa  353  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  55.89 
 
 		 345 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0260  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 		 347 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.516664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  55.39 
 
 		 349 aa  352  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2240  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 345 aa  352  4e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  56.16 
 
 		 347 aa  352  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.65 
 
 		 344 aa  352  7e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  56.88 
 
 		 344 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  56.57 
 
 		 344 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  54.68 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  56.63 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  56.93 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  56.63 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  56.27 
 
 		 347 aa  350  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  54.88 
 
 		 347 aa  349  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1003  rod shape-determining protein MreB  56.25 
 
 		 345 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2329  rod shape-determining protein MreB  56.25 
 
 		 345 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1600  rod shape-determining protein MreB  56.55 
 
 		 345 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  56.27 
 
 		 346 aa  349  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 		 345 aa  349  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3472  rod shape-determining protein MreB  56.29 
 
 		 349 aa  348  6e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000392935  normal  0.627264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0479  rod shape-determining protein MreB  56.29 
 
 		 349 aa  348  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000232389  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3648  rod shape-determining protein MreB  56.29 
 
 		 349 aa  348  6e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000380554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  56.57 
 
 		 347 aa  348  7e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4098  rod shape-determining protein MreB  56.29 
 
 		 349 aa  348  8e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  56.19 
 
 		 344 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  55.26 
 
 		 346 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1248  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.04 
 
 		 345 aa  348  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0506008  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0467  rod shape-determining protein MreB  55.99 
 
 		 349 aa  347  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000395514  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0574  rod shape-determining protein MreB  56.29 
 
 		 349 aa  347  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000161982  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3738  rod shape-determining protein MreB  56.29 
 
 		 349 aa  348  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000049309  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  55.96 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  55.56 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  55.26 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  54.97 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  54.97 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  54.01 
 
 		 346 aa  345  5e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  55.26 
 
 		 347 aa  345  6e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  54.68 
 
 		 347 aa  345  8.999999999999999e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  55.26 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  53.8 
 
 		 340 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0497  rod shape-determining protein MreB  55.99 
 
 		 349 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3822  rod shape-determining protein MreB  55.99 
 
 		 349 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0403  rod shape-determining protein MreB  55.99 
 
 		 349 aa  344  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  55.21 
 
 		 343 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0518  rod shape-determining protein MreB  55.99 
 
 		 349 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000418886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  54.01 
 
 		 350 aa  343  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0522  rod shape-determining protein MreB  55.99 
 
 		 349 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000845532  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0181  rod shape-determining protein MreB  57.45 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306812  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0146  rod shape-determining protein MreB  57.45 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.949868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2294  rod shape-determining protein MreB  57.45 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.691991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>