More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1417 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1417  integration host factor, alpha subunit  100 
 
 		 97 aa  194  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.097817  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2365  integration host factor subunit alpha  72.04 
 
 		 98 aa  143  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3557  integration host factor subunit alpha  67.02 
 
 		 100 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1269  integration host factor subunit alpha  65.26 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.272817 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1913  integration host factor subunit alpha  65.26 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2611  integration host factor subunit alpha  65.26 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1721  integration host factor subunit alpha  64.58 
 
 		 101 aa  130  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0913  integration host factor subunit alpha  62.11 
 
 		 100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1863  integration host factor subunit alpha  63.16 
 
 		 102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00832208  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_004310  BR0778  integration host factor subunit alpha  59.57 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2518  integration host factor subunit alpha  59.57 
 
 		 107 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0771  integration host factor subunit alpha  59.57 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.801748  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1668  integration host factor, alpha subunit  57.45 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0268  integration host factor, alpha subunit  65.52 
 
 		 104 aa  120  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7074  integration host factor, alpha subunit  55.21 
 
 		 105 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6231  integration host factor, alpha subunit  55.21 
 
 		 104 aa  120  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.75949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1522  integration host factor, alpha subunit  60.64 
 
 		 101 aa  119  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00263552  normal  0.735039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1783  integration host factor subunit alpha  58.95 
 
 		 100 aa  118  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783563  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3294  integration host factor, alpha subunit  60.87 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.13347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0830  integration host factor subunit alpha  56.38 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120813  normal  0.0891496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2016  histone family protein DNA-binding protein  54.17 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4386  integration host factor subunit alpha  54.17 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0651  integration host factor, alpha subunit  55.91 
 
 		 112 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1287  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 112 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.921659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1198  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2055  histone family protein DNA-binding protein  54.17 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2330  histone family protein DNA-binding protein  54.17 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.45414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3967  histone family protein DNA-binding protein  52.08 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0228483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1147  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.205645  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3378  integration host factor, alpha subunit  53.26 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4630  integration host factor subunit alpha  52.69 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00633863  normal  0.0311538 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0639  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3021  integration host factor subunit alpha  52.13 
 
 		 118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4986  histone family protein DNA-binding protein  52.08 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777024  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2651  integration host factor subunit alpha  53.33 
 
 		 123 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.030982  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1587  integration host factor subunit alpha  51.58 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.526192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2677  integration host factor subunit alpha  53.33 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00137939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2687  integration host factor subunit alpha  53.33 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1631  integration host factor subunit alpha  52.13 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1408  integration host factor subunit alpha  52.22 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.422535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3032  integration host factor subunit alpha  52.13 
 
 		 100 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814183  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2924  integration host factor, alpha subunit  54.44 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242436  hitchhiker  0.000500218 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0918  integration host factor, alpha subunit  50.56 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2510  integration host factor subunit alpha  51.65 
 
 		 100 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28720  integration host factor subunit alpha  51.65 
 
 		 100 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000206678  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2471  integration host factor subunit alpha  50.55 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3219  integration host factor subunit alpha  50.55 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3475  integration host factor subunit alpha  50.55 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981005  hitchhiker  0.00278356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1973  integration host factor subunit alpha  50.55 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0364622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1982  integration host factor subunit alpha  50.55 
 
 		 100 aa  103  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219997  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2384  integration host factor, alpha subunit  50.55 
 
 		 100 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2168  integration host factor subunit alpha  50.55 
 
 		 100 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1937  integration host factor subunit alpha  50.55 
 
 		 100 aa  103  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0682795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1456  integration host factor, alpha subunit  51.69 
 
 		 99 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.405955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1583  integration host factor subunit alpha  47.78 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1997  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 100 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000120885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2055  integration host factor subunit alpha  50.56 
 
 		 100 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549761  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1166  integration host factor subunit alpha  54.44 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1146  integration host factor subunit alpha  51.69 
 
 		 99 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0580836  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0762  integration host factor subunit alpha  51.69 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.306695  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1583  integration host factor subunit alpha  53.33 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1641  integration host factor subunit alpha  53.33 
 
 		 138 aa  100  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860546  normal  0.370826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3019  integration host factor subunit alpha  52.22 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.616425  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1013  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00925023 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1971  integration host factor subunit alpha  53.33 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1805  integration host factor, alpha subunit  48.35 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2671  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 100 aa  100  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.998853 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1661  integration host factor, alpha subunit  48.31 
 
 		 97 aa  100  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  45.65 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0433  integration host factor subunit alpha  48.89 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  45.65 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1281  integration host factor subunit alpha  52.22 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1552  integration host factor, alpha subunit  51.09 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  46.15 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1458  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1405  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4621  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0493  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1604  integration host factor subunit alpha  49.44 
 
 		 99 aa  98.2  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316087  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0999  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2750  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1365  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1481  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1741  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1718  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1090  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1897  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0969  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1773  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.330159 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1533  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.612274  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1377  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377563  normal  0.528891 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0197  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.878199  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2589  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 98 aa  97.4  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2237  integration host factor, alpha subunit  49.45 
 
 		 99 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0376768 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  53.33 
 
 		 96 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2608  integration host factor, alpha subunit  49.45 
 
 		 99 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1327  integration host factor, alpha subunit  44.44 
 
 		 113 aa  96.7  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125041  hitchhiker  0.0021642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 92 aa  97.1  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0846  integration host factor subunit alpha  48.31 
 
 		 98 aa  97.1  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000670658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>