More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1692 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 149 aa  296  5e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  56.25 
 
 		 148 aa  167  7e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  45.14 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  39.87 
 
 		 171 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  43.66 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  39.46 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 160 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  42.96 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.24 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  44.44 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 193 aa  114  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 148 aa  114  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 151 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  41.72 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  35.29 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 170 aa  110  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 151 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  38.78 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  33.79 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 189 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  40.13 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 179 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 188 aa  107  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 209 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 204 aa  107  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 201 aa  106  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 190 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 202 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  37.67 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  43.42 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 189 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 149 aa  103  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 179 aa  103  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  35.81 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  42.96 
 
 		 189 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0007  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  40.65 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  44 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  32.88 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  37.12 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  41.45 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 194 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  42.22 
 
 		 189 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 191 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  37.41 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 189 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 199 aa  100  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2415  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 202 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295062  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 189 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>