More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0564 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0564  GrpE protein  100 
 
 		 211 aa  414  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  34.48 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  38.69 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 		 191 aa  101  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1196  GrpE protein  33.51 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  35.9 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  36.24 
 
 		 194 aa  98.6  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  33.33 
 
 		 172 aa  98.6  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  34.03 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  34.03 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  34.03 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  34.03 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  34.03 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  34.03 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  34.03 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  35.48 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  37.66 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  33.54 
 
 		 172 aa  97.1  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  34.47 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  35 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  35.4 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  34.95 
 
 		 189 aa  93.2  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  33.7 
 
 		 190 aa  92.4  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  32.32 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  34.04 
 
 		 187 aa  92  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  35.03 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  27.46 
 
 		 194 aa  89  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  33.12 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  34.35 
 
 		 174 aa  88.2  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  31.48 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  32.1 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  37.39 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  32.47 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  33.33 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  35.22 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  30.13 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  31.25 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  28.48 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  27.89 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  30.86 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  28.48 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1359  GrpE protein  34.87 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  29.46 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  30.68 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  32 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  31.01 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0088  GrpE protein  29.19 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.141966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  29.46 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  31.17 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  37.41 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  31.58 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  26.7 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  29.32 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  28.3 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  35.48 
 
 		 162 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  28.14 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  28.14 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  28.14 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  29.84 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  33.33 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  30 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  31.54 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  30.38 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  32.67 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  33.64 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  26.8 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  27.38 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  30.37 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  32.78 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  29.67 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  30.13 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  32.81 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  31.61 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  29.84 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2133  HSP70 family protein GrpE  30.49 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0603928  normal  0.40294 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  30.16 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  29.89 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  30.65 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  30.65 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  31.54 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  28.74 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  30.65 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  29.84 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  29.3 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1243  GrpE protein  27.27 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.847683  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  27.71 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  29.2 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  29.63 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  33.82 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  29.2 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  30.52 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  29.84 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  29.32 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  35.56 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>