105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3324 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3324  acetyltransferase  100 
 
 		 203 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1289  acetyltransferase  86.75 
 
 		 173 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1219  acetyltransferase  86.14 
 
 		 173 aa  299  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1218  acetyltransferase  86.14 
 
 		 173 aa  298  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.148458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  72.12 
 
 		 170 aa  255  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0312822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  63.64 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  64.24 
 
 		 173 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  63.64 
 
 		 169 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  64.24 
 
 		 169 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  48.15 
 
 		 177 aa  161  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1538  GCN5-related N-acetyltransferase  46.11 
 
 		 170 aa  153  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  46.3 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  48.5 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167968 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1298  GCN5-related N-acetyltransferase  46.34 
 
 		 166 aa  151  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1251  GCN5-related N-acetyltransferase  46.07 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  35.58 
 
 		 320 aa  95.9  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  29.75 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  25.61 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  25.79 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  26.11 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  27.54 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  24.54 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  24.54 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 		 174 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 161 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  27.7 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  27.45 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  28.36 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  28.36 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  27.61 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  26.25 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  28.36 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  25.33 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  28.67 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  26.28 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2811  acetyltransferase  25.14 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  26.04 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  25.69 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  23.33 
 
 		 154 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  25.33 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  20.86 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  23.31 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 		 124 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3185  GCN5-related N-acetyltransferase  26.86 
 
 		 159 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.082232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1473  acetyltransferase  24.26 
 
 		 128 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000250439  hitchhiker  0.00000579727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  24.5 
 
 		 156 aa  51.6  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  22.54 
 
 		 158 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0451  acetyltransferase  29.1 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.723991 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  28.97 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  28.97 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  28.97 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  27.69 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  26.9 
 
 		 150 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  26.9 
 
 		 150 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  26.9 
 
 		 150 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3814  GCN5-related N-acetyltransferase  22.22 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  24.07 
 
 		 166 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0154  GCN5-related N-acetyltransferase  36.07 
 
 		 150 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 146 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000658467  normal  0.508858 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10731  GCN5-related N-acetyltransferase  26.02 
 
 		 158 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  21.62 
 
 		 173 aa  45.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3001  GCN5-related N-acetyltransferase  24.2 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4152  thioesterase domain protein  33.33 
 
 		 313 aa  45.1  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 180 aa  44.7  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05473  putative acyltransferase protein  27.15 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4411  thioesterase/acetyltransferase domain-containing protein  31.33 
 
 		 313 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03773  putative acetyltransferase  30.12 
 
 		 329 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871645  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4098  thioesterase domain protein  30.12 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4113  acetyltransferase  30.12 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4130  thioesterase domain-containing protein  30.12 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.480913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4273  acetyltransferase  30.12 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4366  acetyltransferase, GNAT family  30.12 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 		 161 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5335  acetyltransferase, GNAT family  30.12 
 
 		 329 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.251571 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2410  acetyltransferase, GNAT family  27.66 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03722  hypothetical protein  30.12 
 
 		 329 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.645417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  24.82 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1001  acetyltransferase  23.58 
 
 		 159 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.219128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  22.01 
 
 		 154 aa  42.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3861  GCN5-related N-acetyltransferase  28.05 
 
 		 173 aa  42  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2515  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.88 
 
 		 378 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.291701  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  28.72 
 
 		 169 aa  41.6  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  25.2 
 
 		 161 aa  41.6  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000283467  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>