More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1660 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  100 
 
 		 538 aa  1106    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  54.19 
 
 		 536 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  54.19 
 
 		 536 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  37.65 
 
 		 557 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.58 
 
 		 558 aa  246  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.02 
 
 		 555 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.51 
 
 		 554 aa  219  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  28.8 
 
 		 521 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  28.8 
 
 		 521 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.42 
 
 		 438 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.2 
 
 		 593 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.1 
 
 		 598 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  31.54 
 
 		 596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.97 
 
 		 624 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.45 
 
 		 605 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2064  mismatch repair ATPase  27.23 
 
 		 427 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  29.05 
 
 		 601 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.52 
 
 		 610 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.04 
 
 		 615 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  30.21 
 
 		 601 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.81 
 
 		 607 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.49 
 
 		 626 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  27.85 
 
 		 595 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  27.85 
 
 		 595 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.55 
 
 		 586 aa  109  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.33 
 
 		 597 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.37 
 
 		 597 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.74 
 
 		 610 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  25.64 
 
 		 590 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.66 
 
 		 618 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 888 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 888 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  25.93 
 
 		 597 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  27.8 
 
 		 883 aa  99  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  28.06 
 
 		 927 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  25.42 
 
 		 867 aa  97.8  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0916  hypothetical protein  30.99 
 
 		 685 aa  97.4  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0756379 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  25.37 
 
 		 594 aa  97.1  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  23.69 
 
 		 604 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  31.02 
 
 		 907 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  27.37 
 
 		 872 aa  93.6  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  27.92 
 
 		 872 aa  93.2  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  29.22 
 
 		 243 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  25.78 
 
 		 590 aa  92.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  26.76 
 
 		 859 aa  92.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  29.25 
 
 		 868 aa  91.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  26.56 
 
 		 852 aa  90.9  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  23.51 
 
 		 956 aa  90.9  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  25 
 
 		 905 aa  90.5  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  28.16 
 
 		 858 aa  89  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  25.27 
 
 		 917 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  24.19 
 
 		 848 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  25.7 
 
 		 870 aa  88.6  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  27.3 
 
 		 860 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  25.7 
 
 		 870 aa  88.6  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  26.33 
 
 		 869 aa  87.8  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  26.57 
 
 		 870 aa  87.4  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  29.15 
 
 		 882 aa  87.4  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  25 
 
 		 871 aa  87  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  24.41 
 
 		 823 aa  86.3  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  26.79 
 
 		 885 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  27.35 
 
 		 828 aa  86.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  24 
 
 		 893 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  30.8 
 
 		 896 aa  85.9  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  26.76 
 
 		 927 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  26.91 
 
 		 854 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  25.72 
 
 		 869 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  26.96 
 
 		 881 aa  85.9  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  25.36 
 
 		 853 aa  85.1  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0078  DNA mismatch repair protein MutS  27.04 
 
 		 903 aa  85.1  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.167909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  26.98 
 
 		 817 aa  85.5  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  26.62 
 
 		 901 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  28.81 
 
 		 897 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  30.57 
 
 		 848 aa  84  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  26.89 
 
 		 854 aa  83.6  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  29.52 
 
 		 846 aa  83.6  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  26.06 
 
 		 850 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  24.57 
 
 		 882 aa  83.6  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  24.79 
 
 		 918 aa  82.8  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  26.1 
 
 		 856 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  21.99 
 
 		 863 aa  83.2  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  27.24 
 
 		 862 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  25.9 
 
 		 851 aa  82.8  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  25.46 
 
 		 865 aa  83.2  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  26.1 
 
 		 872 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  29.05 
 
 		 846 aa  82.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  24 
 
 		 853 aa  82.4  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  31.55 
 
 		 913 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  24.82 
 
 		 854 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  25.18 
 
 		 854 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  26.1 
 
 		 872 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  24.82 
 
 		 852 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  25.11 
 
 		 854 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  26.1 
 
 		 856 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  27.47 
 
 		 862 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  26.51 
 
 		 861 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  25.7 
 
 		 856 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  26.1 
 
 		 856 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  30.73 
 
 		 804 aa  80.9  0.00000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  26.1 
 
 		 856 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>