More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2434 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2434  Cof protein  100 
 
 
282 aa  558  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  37.59 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  30.86 
 
 
278 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  32.1 
 
 
268 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  34.33 
 
 
269 aa  133  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  34.07 
 
 
272 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  35.21 
 
 
271 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  33.21 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  30.11 
 
 
266 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  30.04 
 
 
266 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  29.85 
 
 
267 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  27.37 
 
 
274 aa  122  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  29.3 
 
 
266 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  30.71 
 
 
268 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  28.04 
 
 
269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  33.6 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  31.6 
 
 
271 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  31.09 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  26.72 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  30 
 
 
270 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  29.89 
 
 
264 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  29.71 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  29.06 
 
 
268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  23.68 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  31.64 
 
 
271 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 
273 aa  106  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  31.64 
 
 
271 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  27.72 
 
 
273 aa  105  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1119  Cof-like hydrolase  31.64 
 
 
271 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.78603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  28.21 
 
 
273 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  29.26 
 
 
281 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  29.63 
 
 
277 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  29.26 
 
 
281 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  29.59 
 
 
269 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4042  Cof-like hydrolase  27.08 
 
 
271 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  29.21 
 
 
269 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4000  Cof-like hydrolase  26.74 
 
 
271 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  28.52 
 
 
270 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  28.52 
 
 
270 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  28.52 
 
 
270 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  28.52 
 
 
270 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  28.52 
 
 
270 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  29.48 
 
 
270 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  28.52 
 
 
270 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  27.31 
 
 
273 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  29.63 
 
 
273 aa  102  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  25.96 
 
 
279 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  29.48 
 
 
270 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  28.89 
 
 
270 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  29.21 
 
 
269 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  28.89 
 
 
281 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3223  Cof-like hydrolase  28.73 
 
 
273 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  28.52 
 
 
270 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  25.61 
 
 
279 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  28.52 
 
 
270 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  27.17 
 
 
270 aa  99.8  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  27.05 
 
 
268 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  24.63 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  24.18 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  29.7 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  30.11 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  28.46 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  29.7 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  26.84 
 
 
267 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  30.63 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  26.84 
 
 
267 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0934  phosphotransferase  29.7 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.600795 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  27.41 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  29.7 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  29.32 
 
 
286 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  26.6 
 
 
271 aa  95.5  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0525  Cof-like hydrolase  22.73 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  28.04 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  23.64 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  28.09 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0138  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  28.09 
 
 
273 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  26.95 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  27.55 
 
 
272 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  26.1 
 
 
269 aa  94  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  27.17 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  27.17 
 
 
272 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  27.17 
 
 
272 aa  92.4  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  27.06 
 
 
273 aa  92.4  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  27.84 
 
 
272 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  27.17 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  27.17 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  27.17 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  21.4 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.7 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  27.84 
 
 
265 aa  89  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  25.7 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.7 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  25.7 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  25.7 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0986  hypothetical protein  28.14 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  25.7 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  27.14 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.7 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>