More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2194 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2194  SUF system FeS assembly protein  100 
 
 		 161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2531  NifU family SUF system FeS assembly protein  60.77 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0314  NifU family SUF system FeS assembly protein  50 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.764118  normal  0.0431709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0719  NifU domain-containing protein  53.66 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0403016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0977  nitrogen-fixing NifU-like protein  41.48 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.64156  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.83 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.8 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.3 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2247  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.81 
 
 		 140 aa  85.1  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.66 
 
 		 128 aa  84.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.81 
 
 		 143 aa  84.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0953  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.72 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.23 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.94 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.2 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5396  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.29 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  36.17 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2186  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.37 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  32.77 
 
 		 211 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2138  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.37 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.09 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.61 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  36.43 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.65 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.67 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  34.81 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  36.43 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.85 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  33.85 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.31 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.09 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  34.06 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.77 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  29.6 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11493  nitrogen fixation-like protein  33.09 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220118  normal  0.138949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  33.1 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.75 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  33.82 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2476  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.34 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.44 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2440  SUF system FeS assembly protein  30.77 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2485  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.77 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.31 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.66 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  33.82 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.59 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  33.33 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.61 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.61 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1967  SUF system FeS assembly protein  35.77 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.245372 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  33.09 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  31.2 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  33.61 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  33.61 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  33.61 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  33.61 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  34.04 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.59 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0144  NifU family protein  33.58 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.59 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.12 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  31.71 
 
 		 123 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1110  Fe-S cluster formation protein, NifU-like  32.39 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  32 
 
 		 130 aa  67  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1145  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.2 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.33 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.62 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  28.38 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  45.95 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  32.31 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  46.48 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  30.33 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  32.79 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  31.45 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  29.77 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.84 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.59 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  50.75 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  31.3 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.09 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.1 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  29.75 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  29.75 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  27.01 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5982  nitrogen fixation protein  33.08 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.8626  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.48 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000288131  hitchhiker  0.00804986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.82 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  27.01 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  30.58 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  30.65 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  30.16 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  31.15 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  29.51 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  30.65 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  31.34 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.07 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  30.16 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  30.33 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  29.84 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  30.65 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>