More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1968 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1968  Sec-independent protein translocase TatC  100 
 
 
270 aa  533  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0167  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.08 
 
 
256 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.218046  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  37.61 
 
 
283 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  35.47 
 
 
230 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.1 
 
 
251 aa  148  8e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1229  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.77 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.672441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1120  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.34 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.46 
 
 
257 aa  145  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1459  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.08 
 
 
288 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.628358  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  35.89 
 
 
247 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.77 
 
 
258 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1102  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.86 
 
 
339 aa  143  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.462043  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.34 
 
 
241 aa  142  5e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0210  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.4 
 
 
261 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.94 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.45 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.52 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.78 
 
 
257 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.73 
 
 
268 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.94 
 
 
264 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.22 
 
 
257 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.47 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  34.44 
 
 
245 aa  135  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  34.67 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  33.33 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1191  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.2 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.134243  normal  0.295953 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.93 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1535  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.29 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0987  Sec-independent protein translocase TatC  33.76 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  34.44 
 
 
245 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.17 
 
 
259 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2653  Sec-independent protein translocase TatC  35.32 
 
 
284 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  34.02 
 
 
245 aa  132  6e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.68 
 
 
249 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  33.48 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0964  Sec-independent periplasmic protein translocase  34.73 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  36.44 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.9 
 
 
270 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.6 
 
 
263 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.07 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  33.86 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  34.15 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.91 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03838  twin arginine-targeting protein translocase TatC  36.86 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1822  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.62 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.11 
 
 
259 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  33.62 
 
 
261 aa  128  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.71 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000685633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2273  TatCD protein  32.91 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231402  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  33.19 
 
 
368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1646  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.05 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000520581  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.89 
 
 
468 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  33.19 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  31.68 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  31.5 
 
 
262 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.5 
 
 
262 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.5 
 
 
262 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.44 
 
 
263 aa  125  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2355  TatCD protein  32.11 
 
 
247 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2089  TatCD protein  32.05 
 
 
247 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2029  sec-independent protein translocase  32.05 
 
 
247 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2270  TatCD protein  32.05 
 
 
247 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29917e-36 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  32.77 
 
 
262 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.02 
 
 
261 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  32.63 
 
 
244 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1291  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.33 
 
 
252 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.02 
 
 
261 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  30.89 
 
 
268 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  33.48 
 
 
250 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.32 
 
 
258 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.89 
 
 
268 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3632  Sec-independent protein translocase TatC  29.8 
 
 
267 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2243  TatCD protein  32.61 
 
 
242 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000509204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0227  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.48 
 
 
248 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000248911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2027  sec-independent protein translocase  30.89 
 
 
247 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.03 
 
 
265 aa  122  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.78 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  34.68 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.2 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3536  Sec-independent protein translocase TatC  32.92 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.460753 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  31.76 
 
 
258 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.76 
 
 
258 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.76 
 
 
258 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  32.11 
 
 
269 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  33.33 
 
 
251 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  30.53 
 
 
266 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2320  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.9 
 
 
298 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000595398  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.76 
 
 
258 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.76 
 
 
258 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.76 
 
 
258 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  31.76 
 
 
258 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.76 
 
 
258 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.46 
 
 
260 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.76 
 
 
258 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1740  SEC-independent protein translocase  36.8 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1220  Sec-independent periplasmic protein translocase  32.77 
 
 
327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  30.4 
 
 
323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.46 
 
 
241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2226  TatCD protein  31.72 
 
 
246 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000435939  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1668  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.44 
 
 
246 aa  118  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>